Protein–RNA interactions for Protein: Q15034

HERC3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3Q15034 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC17.56■□□□□ 0.4
HERC3Q15034 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HERC3Q15034 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HERC3Q15034 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HERC3Q15034 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HERC3Q15034 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
HERC3Q15034 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
HERC3Q15034 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
HERC3Q15034 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
HERC3Q15034 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
HERC3Q15034 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
HERC3Q15034 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
HERC3Q15034 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
HERC3Q15034 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HERC3Q15034 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
HERC3Q15034 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
HERC3Q15034 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HERC3Q15034 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
HERC3Q15034 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
HERC3Q15034 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HERC3Q15034 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
HERC3Q15034 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HERC3Q15034 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
HERC3Q15034 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HERC3Q15034 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
HERC3Q15034 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HERC3Q15034 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HERC3Q15034 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
HERC3Q15034 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
HERC3Q15034 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HERC3Q15034 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
HERC3Q15034 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
HERC3Q15034 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
HERC3Q15034 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HERC3Q15034 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HERC3Q15034 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
HERC3Q15034 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HERC3Q15034 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
HERC3Q15034 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
HERC3Q15034 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HERC3Q15034 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HERC3Q15034 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
HERC3Q15034 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
HERC3Q15034 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
HERC3Q15034 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HERC3Q15034 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HERC3Q15034 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
HERC3Q15034 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HERC3Q15034 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HERC3Q15034 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
HERC3Q15034 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HERC3Q15034 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
HERC3Q15034 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HERC3Q15034 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HERC3Q15034 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
HERC3Q15034 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HERC3Q15034 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HERC3Q15034 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HERC3Q15034 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HERC3Q15034 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
HERC3Q15034 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HERC3Q15034 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HERC3Q15034 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HERC3Q15034 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HERC3Q15034 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
HERC3Q15034 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
HERC3Q15034 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HERC3Q15034 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
HERC3Q15034 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HERC3Q15034 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HERC3Q15034 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
HERC3Q15034 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
HERC3Q15034 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HERC3Q15034 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HERC3Q15034 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
HERC3Q15034 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
HERC3Q15034 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
HERC3Q15034 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
HERC3Q15034 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HERC3Q15034 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
HERC3Q15034 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HERC3Q15034 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
HERC3Q15034 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HERC3Q15034 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
HERC3Q15034 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HERC3Q15034 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HERC3Q15034 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HERC3Q15034 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
HERC3Q15034 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HERC3Q15034 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HERC3Q15034 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
HERC3Q15034 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
HERC3Q15034 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
HERC3Q15034 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HERC3Q15034 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HERC3Q15034 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HERC3Q15034 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HERC3Q15034 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HERC3Q15034 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HERC3Q15034 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
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