Protein–RNA interactions for Protein: Q14990

ODF1, Outer dense fiber protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 250 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF1Q14990 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
ODF1Q14990 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
ODF1Q14990 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ODF1Q14990 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ODF1Q14990 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ODF1Q14990 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ODF1Q14990 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ODF1Q14990 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
ODF1Q14990 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC12.73□□□□□ -0.37
ODF1Q14990 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
ODF1Q14990 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ODF1Q14990 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ODF1Q14990 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
ODF1Q14990 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
ODF1Q14990 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ODF1Q14990 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
ODF1Q14990 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ODF1Q14990 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
ODF1Q14990 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ODF1Q14990 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ODF1Q14990 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
ODF1Q14990 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
ODF1Q14990 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
ODF1Q14990 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
ODF1Q14990 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.73□□□□□ -0.37
ODF1Q14990 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ODF1Q14990 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ODF1Q14990 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
ODF1Q14990 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ODF1Q14990 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
ODF1Q14990 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
ODF1Q14990 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
ODF1Q14990 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
ODF1Q14990 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC12.72□□□□□ -0.37
ODF1Q14990 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
ODF1Q14990 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
ODF1Q14990 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
ODF1Q14990 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
ODF1Q14990 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
ODF1Q14990 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
ODF1Q14990 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
ODF1Q14990 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
ODF1Q14990 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
ODF1Q14990 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
ODF1Q14990 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
ODF1Q14990 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
ODF1Q14990 ACKR3-201ENST00000272928 2203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
ODF1Q14990 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
ODF1Q14990 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
ODF1Q14990 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
ODF1Q14990 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
ODF1Q14990 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
ODF1Q14990 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
ODF1Q14990 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
ODF1Q14990 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
ODF1Q14990 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
ODF1Q14990 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
ODF1Q14990 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
ODF1Q14990 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
ODF1Q14990 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
ODF1Q14990 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC12.72□□□□□ -0.37
ODF1Q14990 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
ODF1Q14990 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
ODF1Q14990 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
ODF1Q14990 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
ODF1Q14990 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
ODF1Q14990 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
ODF1Q14990 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
ODF1Q14990 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
ODF1Q14990 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
ODF1Q14990 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
ODF1Q14990 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
ODF1Q14990 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
ODF1Q14990 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
ODF1Q14990 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
ODF1Q14990 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC12.71□□□□□ -0.37
ODF1Q14990 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
ODF1Q14990 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
ODF1Q14990 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
ODF1Q14990 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
ODF1Q14990 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
ODF1Q14990 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
ODF1Q14990 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
ODF1Q14990 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
ODF1Q14990 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
ODF1Q14990 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
ODF1Q14990 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
ODF1Q14990 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
ODF1Q14990 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
ODF1Q14990 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
ODF1Q14990 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC12.71□□□□□ -0.37
ODF1Q14990 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
ODF1Q14990 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
ODF1Q14990 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
ODF1Q14990 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
ODF1Q14990 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
ODF1Q14990 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
ODF1Q14990 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
ODF1Q14990 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
ODF1Q14990 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms