Protein–RNA interactions for Protein: Q14031

COL4A6, Collagen alpha-6(IV) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A6Q14031 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
COL4A6Q14031 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
COL4A6Q14031 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
COL4A6Q14031 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
COL4A6Q14031 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
COL4A6Q14031 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
COL4A6Q14031 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
COL4A6Q14031 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
COL4A6Q14031 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
COL4A6Q14031 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
COL4A6Q14031 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
COL4A6Q14031 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
COL4A6Q14031 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
COL4A6Q14031 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
COL4A6Q14031 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
COL4A6Q14031 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
COL4A6Q14031 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
COL4A6Q14031 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
COL4A6Q14031 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
COL4A6Q14031 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
COL4A6Q14031 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
COL4A6Q14031 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
COL4A6Q14031 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
COL4A6Q14031 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
COL4A6Q14031 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
COL4A6Q14031 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
COL4A6Q14031 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.87■□□□□ 0.61
COL4A6Q14031 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
COL4A6Q14031 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
COL4A6Q14031 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
COL4A6Q14031 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
COL4A6Q14031 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
COL4A6Q14031 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
COL4A6Q14031 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
COL4A6Q14031 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
COL4A6Q14031 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
COL4A6Q14031 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
COL4A6Q14031 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
COL4A6Q14031 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
COL4A6Q14031 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
COL4A6Q14031 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
COL4A6Q14031 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
COL4A6Q14031 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
COL4A6Q14031 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
COL4A6Q14031 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
COL4A6Q14031 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
COL4A6Q14031 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
COL4A6Q14031 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
COL4A6Q14031 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
COL4A6Q14031 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
COL4A6Q14031 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
COL4A6Q14031 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
COL4A6Q14031 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
COL4A6Q14031 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
COL4A6Q14031 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
COL4A6Q14031 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
COL4A6Q14031 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
COL4A6Q14031 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
COL4A6Q14031 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
COL4A6Q14031 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
COL4A6Q14031 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
COL4A6Q14031 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
COL4A6Q14031 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
COL4A6Q14031 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
COL4A6Q14031 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
COL4A6Q14031 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
COL4A6Q14031 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
COL4A6Q14031 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
COL4A6Q14031 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
COL4A6Q14031 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
COL4A6Q14031 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
COL4A6Q14031 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
COL4A6Q14031 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
COL4A6Q14031 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
COL4A6Q14031 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
COL4A6Q14031 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
COL4A6Q14031 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
COL4A6Q14031 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
COL4A6Q14031 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
COL4A6Q14031 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
COL4A6Q14031 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
COL4A6Q14031 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
COL4A6Q14031 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
COL4A6Q14031 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
COL4A6Q14031 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
COL4A6Q14031 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
COL4A6Q14031 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
COL4A6Q14031 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
COL4A6Q14031 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
COL4A6Q14031 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
COL4A6Q14031 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
COL4A6Q14031 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
COL4A6Q14031 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
COL4A6Q14031 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
COL4A6Q14031 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
COL4A6Q14031 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
COL4A6Q14031 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
COL4A6Q14031 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
COL4A6Q14031 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
COL4A6Q14031 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms