Protein–RNA interactions for Protein: Q13868

EXOSC2, Exosome complex component RRP4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC2Q13868 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
EXOSC2Q13868 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
EXOSC2Q13868 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
EXOSC2Q13868 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
EXOSC2Q13868 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
EXOSC2Q13868 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
EXOSC2Q13868 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
EXOSC2Q13868 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
EXOSC2Q13868 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
EXOSC2Q13868 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
EXOSC2Q13868 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
EXOSC2Q13868 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
EXOSC2Q13868 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
EXOSC2Q13868 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
EXOSC2Q13868 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
EXOSC2Q13868 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
EXOSC2Q13868 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
EXOSC2Q13868 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
EXOSC2Q13868 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EXOSC2Q13868 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EXOSC2Q13868 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
EXOSC2Q13868 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EXOSC2Q13868 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EXOSC2Q13868 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
EXOSC2Q13868 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
EXOSC2Q13868 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
EXOSC2Q13868 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
EXOSC2Q13868 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EXOSC2Q13868 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EXOSC2Q13868 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
EXOSC2Q13868 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EXOSC2Q13868 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EXOSC2Q13868 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
EXOSC2Q13868 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EXOSC2Q13868 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EXOSC2Q13868 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
EXOSC2Q13868 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
EXOSC2Q13868 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
EXOSC2Q13868 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
EXOSC2Q13868 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
EXOSC2Q13868 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EXOSC2Q13868 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
EXOSC2Q13868 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
EXOSC2Q13868 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EXOSC2Q13868 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
EXOSC2Q13868 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
EXOSC2Q13868 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
EXOSC2Q13868 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
EXOSC2Q13868 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
EXOSC2Q13868 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
EXOSC2Q13868 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
EXOSC2Q13868 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EXOSC2Q13868 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
EXOSC2Q13868 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EXOSC2Q13868 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EXOSC2Q13868 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EXOSC2Q13868 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
EXOSC2Q13868 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EXOSC2Q13868 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
EXOSC2Q13868 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EXOSC2Q13868 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
EXOSC2Q13868 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
EXOSC2Q13868 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
EXOSC2Q13868 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
EXOSC2Q13868 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
EXOSC2Q13868 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
EXOSC2Q13868 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
EXOSC2Q13868 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
EXOSC2Q13868 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
EXOSC2Q13868 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
EXOSC2Q13868 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
EXOSC2Q13868 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
EXOSC2Q13868 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
EXOSC2Q13868 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
EXOSC2Q13868 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
EXOSC2Q13868 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
EXOSC2Q13868 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
EXOSC2Q13868 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
EXOSC2Q13868 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
EXOSC2Q13868 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
EXOSC2Q13868 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
EXOSC2Q13868 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
EXOSC2Q13868 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
EXOSC2Q13868 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
EXOSC2Q13868 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
EXOSC2Q13868 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
EXOSC2Q13868 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
EXOSC2Q13868 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
EXOSC2Q13868 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
EXOSC2Q13868 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
EXOSC2Q13868 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
EXOSC2Q13868 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
EXOSC2Q13868 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
EXOSC2Q13868 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
EXOSC2Q13868 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
EXOSC2Q13868 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
EXOSC2Q13868 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
EXOSC2Q13868 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EXOSC2Q13868 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EXOSC2Q13868 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
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