Protein–RNA interactions for Protein: Q13620

CUL4B, Cullin-4B, humanhuman

Predictions only

Length 913 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4BQ13620 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CUL4BQ13620 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CUL4BQ13620 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CUL4BQ13620 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CUL4BQ13620 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
CUL4BQ13620 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CUL4BQ13620 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
CUL4BQ13620 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CUL4BQ13620 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
CUL4BQ13620 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CUL4BQ13620 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
CUL4BQ13620 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CUL4BQ13620 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CUL4BQ13620 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CUL4BQ13620 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CUL4BQ13620 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CUL4BQ13620 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CUL4BQ13620 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CUL4BQ13620 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CUL4BQ13620 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CUL4BQ13620 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CUL4BQ13620 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CUL4BQ13620 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CUL4BQ13620 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CUL4BQ13620 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CUL4BQ13620 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
CUL4BQ13620 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CUL4BQ13620 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CUL4BQ13620 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CUL4BQ13620 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CUL4BQ13620 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CUL4BQ13620 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
CUL4BQ13620 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
CUL4BQ13620 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CUL4BQ13620 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
CUL4BQ13620 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CUL4BQ13620 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CUL4BQ13620 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CUL4BQ13620 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CUL4BQ13620 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CUL4BQ13620 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CUL4BQ13620 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CUL4BQ13620 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CUL4BQ13620 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CUL4BQ13620 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CUL4BQ13620 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CUL4BQ13620 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CUL4BQ13620 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CUL4BQ13620 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CUL4BQ13620 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CUL4BQ13620 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CUL4BQ13620 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CUL4BQ13620 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CUL4BQ13620 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CUL4BQ13620 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CUL4BQ13620 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CUL4BQ13620 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CUL4BQ13620 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CUL4BQ13620 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CUL4BQ13620 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CUL4BQ13620 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CUL4BQ13620 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CUL4BQ13620 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CUL4BQ13620 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CUL4BQ13620 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
CUL4BQ13620 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CUL4BQ13620 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CUL4BQ13620 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
CUL4BQ13620 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CUL4BQ13620 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CUL4BQ13620 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CUL4BQ13620 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CUL4BQ13620 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CUL4BQ13620 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CUL4BQ13620 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CUL4BQ13620 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CUL4BQ13620 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CUL4BQ13620 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CUL4BQ13620 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CUL4BQ13620 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CUL4BQ13620 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CUL4BQ13620 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CUL4BQ13620 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CUL4BQ13620 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CUL4BQ13620 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CUL4BQ13620 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CUL4BQ13620 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CUL4BQ13620 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CUL4BQ13620 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CUL4BQ13620 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CUL4BQ13620 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CUL4BQ13620 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CUL4BQ13620 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CUL4BQ13620 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
CUL4BQ13620 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CUL4BQ13620 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CUL4BQ13620 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
CUL4BQ13620 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CUL4BQ13620 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CUL4BQ13620 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms