Protein–RNA interactions for Protein: Q13615

MTMR3, Myotubularin-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTMR3Q13615 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
MTMR3Q13615 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
MTMR3Q13615 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
MTMR3Q13615 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
MTMR3Q13615 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
MTMR3Q13615 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
MTMR3Q13615 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
MTMR3Q13615 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
MTMR3Q13615 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
MTMR3Q13615 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
MTMR3Q13615 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
MTMR3Q13615 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
MTMR3Q13615 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
MTMR3Q13615 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
MTMR3Q13615 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
MTMR3Q13615 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
MTMR3Q13615 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
MTMR3Q13615 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
MTMR3Q13615 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
MTMR3Q13615 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
MTMR3Q13615 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
MTMR3Q13615 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
MTMR3Q13615 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
MTMR3Q13615 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
MTMR3Q13615 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
MTMR3Q13615 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
MTMR3Q13615 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
MTMR3Q13615 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
MTMR3Q13615 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
MTMR3Q13615 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
MTMR3Q13615 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
MTMR3Q13615 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
MTMR3Q13615 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
MTMR3Q13615 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
MTMR3Q13615 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
MTMR3Q13615 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
MTMR3Q13615 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
MTMR3Q13615 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
MTMR3Q13615 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
MTMR3Q13615 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
MTMR3Q13615 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
MTMR3Q13615 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
MTMR3Q13615 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
MTMR3Q13615 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
MTMR3Q13615 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
MTMR3Q13615 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
MTMR3Q13615 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
MTMR3Q13615 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
MTMR3Q13615 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
MTMR3Q13615 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
MTMR3Q13615 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
MTMR3Q13615 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
MTMR3Q13615 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
MTMR3Q13615 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
MTMR3Q13615 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
MTMR3Q13615 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
MTMR3Q13615 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
MTMR3Q13615 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
MTMR3Q13615 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
MTMR3Q13615 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
MTMR3Q13615 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
MTMR3Q13615 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
MTMR3Q13615 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
MTMR3Q13615 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
MTMR3Q13615 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
MTMR3Q13615 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
MTMR3Q13615 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
MTMR3Q13615 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
MTMR3Q13615 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
MTMR3Q13615 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
MTMR3Q13615 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
MTMR3Q13615 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
MTMR3Q13615 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
MTMR3Q13615 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
MTMR3Q13615 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
MTMR3Q13615 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
MTMR3Q13615 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
MTMR3Q13615 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
MTMR3Q13615 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
MTMR3Q13615 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
MTMR3Q13615 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
MTMR3Q13615 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
MTMR3Q13615 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
MTMR3Q13615 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
MTMR3Q13615 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
MTMR3Q13615 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
MTMR3Q13615 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
MTMR3Q13615 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
MTMR3Q13615 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
MTMR3Q13615 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
MTMR3Q13615 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
MTMR3Q13615 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
MTMR3Q13615 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
MTMR3Q13615 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
MTMR3Q13615 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
MTMR3Q13615 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
MTMR3Q13615 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
MTMR3Q13615 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
MTMR3Q13615 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
MTMR3Q13615 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
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