Protein–RNA interactions for Protein: Q13568

IRF5, Interferon regulatory factor 5, humanhuman

Predictions only

Length 498 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF5Q13568 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
IRF5Q13568 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
IRF5Q13568 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
IRF5Q13568 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
IRF5Q13568 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
IRF5Q13568 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
IRF5Q13568 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
IRF5Q13568 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
IRF5Q13568 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
IRF5Q13568 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
IRF5Q13568 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
IRF5Q13568 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
IRF5Q13568 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
IRF5Q13568 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
IRF5Q13568 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
IRF5Q13568 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
IRF5Q13568 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
IRF5Q13568 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
IRF5Q13568 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
IRF5Q13568 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
IRF5Q13568 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
IRF5Q13568 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
IRF5Q13568 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
IRF5Q13568 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
IRF5Q13568 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
IRF5Q13568 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
IRF5Q13568 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
IRF5Q13568 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
IRF5Q13568 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
IRF5Q13568 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
IRF5Q13568 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
IRF5Q13568 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
IRF5Q13568 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
IRF5Q13568 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
IRF5Q13568 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
IRF5Q13568 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
IRF5Q13568 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
IRF5Q13568 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
IRF5Q13568 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
IRF5Q13568 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC19.98■□□□□ 0.79
IRF5Q13568 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
IRF5Q13568 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
IRF5Q13568 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
IRF5Q13568 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
IRF5Q13568 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
IRF5Q13568 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
IRF5Q13568 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
IRF5Q13568 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
IRF5Q13568 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
IRF5Q13568 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
IRF5Q13568 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
IRF5Q13568 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
IRF5Q13568 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
IRF5Q13568 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
IRF5Q13568 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
IRF5Q13568 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
IRF5Q13568 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
IRF5Q13568 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
IRF5Q13568 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
IRF5Q13568 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
IRF5Q13568 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
IRF5Q13568 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
IRF5Q13568 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC19.97■□□□□ 0.79
IRF5Q13568 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
IRF5Q13568 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
IRF5Q13568 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
IRF5Q13568 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
IRF5Q13568 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
IRF5Q13568 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
IRF5Q13568 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
IRF5Q13568 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
IRF5Q13568 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
IRF5Q13568 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
IRF5Q13568 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
IRF5Q13568 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
IRF5Q13568 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
IRF5Q13568 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
IRF5Q13568 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
IRF5Q13568 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
IRF5Q13568 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
IRF5Q13568 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
IRF5Q13568 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
IRF5Q13568 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
IRF5Q13568 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
IRF5Q13568 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
IRF5Q13568 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
IRF5Q13568 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
IRF5Q13568 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
IRF5Q13568 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
IRF5Q13568 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
IRF5Q13568 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
IRF5Q13568 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
IRF5Q13568 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
IRF5Q13568 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
IRF5Q13568 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
IRF5Q13568 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
IRF5Q13568 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
IRF5Q13568 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
IRF5Q13568 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
IRF5Q13568 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms