Protein–RNA interactions for Protein: Q13562

NEUROD1, Neurogenic differentiation factor 1, humanhuman

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Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEUROD1Q13562 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
NEUROD1Q13562 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
NEUROD1Q13562 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
NEUROD1Q13562 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
NEUROD1Q13562 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
NEUROD1Q13562 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
NEUROD1Q13562 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
NEUROD1Q13562 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
NEUROD1Q13562 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
NEUROD1Q13562 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
NEUROD1Q13562 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
NEUROD1Q13562 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
NEUROD1Q13562 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
NEUROD1Q13562 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
NEUROD1Q13562 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
NEUROD1Q13562 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
NEUROD1Q13562 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
NEUROD1Q13562 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
NEUROD1Q13562 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
NEUROD1Q13562 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
NEUROD1Q13562 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
NEUROD1Q13562 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
NEUROD1Q13562 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
NEUROD1Q13562 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
NEUROD1Q13562 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
NEUROD1Q13562 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
NEUROD1Q13562 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
NEUROD1Q13562 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
NEUROD1Q13562 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
NEUROD1Q13562 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
NEUROD1Q13562 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
NEUROD1Q13562 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
NEUROD1Q13562 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
NEUROD1Q13562 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
NEUROD1Q13562 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
NEUROD1Q13562 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
NEUROD1Q13562 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
NEUROD1Q13562 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
NEUROD1Q13562 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
NEUROD1Q13562 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
NEUROD1Q13562 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
NEUROD1Q13562 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
NEUROD1Q13562 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
NEUROD1Q13562 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
NEUROD1Q13562 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
NEUROD1Q13562 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
NEUROD1Q13562 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
NEUROD1Q13562 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC26.36■■□□□ 1.81
NEUROD1Q13562 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
NEUROD1Q13562 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
NEUROD1Q13562 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
NEUROD1Q13562 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
NEUROD1Q13562 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
NEUROD1Q13562 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
NEUROD1Q13562 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
NEUROD1Q13562 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
NEUROD1Q13562 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
NEUROD1Q13562 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
NEUROD1Q13562 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
NEUROD1Q13562 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
NEUROD1Q13562 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.35■■□□□ 1.81
NEUROD1Q13562 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
NEUROD1Q13562 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
NEUROD1Q13562 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
NEUROD1Q13562 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
NEUROD1Q13562 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
NEUROD1Q13562 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
NEUROD1Q13562 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
NEUROD1Q13562 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
NEUROD1Q13562 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
NEUROD1Q13562 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
NEUROD1Q13562 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
NEUROD1Q13562 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
NEUROD1Q13562 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC26.35■■□□□ 1.81
NEUROD1Q13562 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
NEUROD1Q13562 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
NEUROD1Q13562 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC26.35■■□□□ 1.81
NEUROD1Q13562 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
NEUROD1Q13562 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
NEUROD1Q13562 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
NEUROD1Q13562 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
NEUROD1Q13562 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
NEUROD1Q13562 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
NEUROD1Q13562 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
NEUROD1Q13562 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
NEUROD1Q13562 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
NEUROD1Q13562 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
NEUROD1Q13562 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
NEUROD1Q13562 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
NEUROD1Q13562 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
NEUROD1Q13562 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
NEUROD1Q13562 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
NEUROD1Q13562 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
NEUROD1Q13562 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
NEUROD1Q13562 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
NEUROD1Q13562 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
NEUROD1Q13562 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
NEUROD1Q13562 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
NEUROD1Q13562 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
NEUROD1Q13562 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
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