Protein–RNA interactions for Protein: Q13309

SKP2, S-phase kinase-associated protein 2, humanhuman

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Length 424 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKP2Q13309 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SKP2Q13309 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SKP2Q13309 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SKP2Q13309 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SKP2Q13309 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SKP2Q13309 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
SKP2Q13309 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SKP2Q13309 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SKP2Q13309 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SKP2Q13309 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SKP2Q13309 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SKP2Q13309 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SKP2Q13309 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SKP2Q13309 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SKP2Q13309 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SKP2Q13309 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SKP2Q13309 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SKP2Q13309 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SKP2Q13309 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SKP2Q13309 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SKP2Q13309 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SKP2Q13309 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SKP2Q13309 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SKP2Q13309 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
SKP2Q13309 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SKP2Q13309 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SKP2Q13309 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SKP2Q13309 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SKP2Q13309 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SKP2Q13309 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SKP2Q13309 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SKP2Q13309 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SKP2Q13309 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SKP2Q13309 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SKP2Q13309 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SKP2Q13309 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SKP2Q13309 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SKP2Q13309 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SKP2Q13309 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SKP2Q13309 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SKP2Q13309 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SKP2Q13309 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SKP2Q13309 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SKP2Q13309 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SKP2Q13309 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SKP2Q13309 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SKP2Q13309 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SKP2Q13309 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SKP2Q13309 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SKP2Q13309 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SKP2Q13309 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SKP2Q13309 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SKP2Q13309 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SKP2Q13309 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SKP2Q13309 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SKP2Q13309 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
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SKP2Q13309 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
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SKP2Q13309 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
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SKP2Q13309 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SKP2Q13309 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
SKP2Q13309 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
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SKP2Q13309 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
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SKP2Q13309 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SKP2Q13309 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SKP2Q13309 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SKP2Q13309 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SKP2Q13309 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SKP2Q13309 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SKP2Q13309 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SKP2Q13309 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SKP2Q13309 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SKP2Q13309 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SKP2Q13309 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SKP2Q13309 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SKP2Q13309 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SKP2Q13309 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SKP2Q13309 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SKP2Q13309 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SKP2Q13309 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SKP2Q13309 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SKP2Q13309 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SKP2Q13309 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
SKP2Q13309 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SKP2Q13309 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
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