Protein–RNA interactions for Protein: Q13258

PTGDR, Prostaglandin D2 receptor, humanhuman

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Length 359 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGDRQ13258 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PTGDRQ13258 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PTGDRQ13258 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PTGDRQ13258 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PTGDRQ13258 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PTGDRQ13258 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PTGDRQ13258 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PTGDRQ13258 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PTGDRQ13258 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PTGDRQ13258 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PTGDRQ13258 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PTGDRQ13258 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PTGDRQ13258 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PTGDRQ13258 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PTGDRQ13258 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PTGDRQ13258 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PTGDRQ13258 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PTGDRQ13258 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PTGDRQ13258 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PTGDRQ13258 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PTGDRQ13258 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PTGDRQ13258 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PTGDRQ13258 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PTGDRQ13258 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PTGDRQ13258 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PTGDRQ13258 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PTGDRQ13258 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PTGDRQ13258 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PTGDRQ13258 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PTGDRQ13258 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PTGDRQ13258 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PTGDRQ13258 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PTGDRQ13258 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PTGDRQ13258 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PTGDRQ13258 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PTGDRQ13258 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
PTGDRQ13258 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
PTGDRQ13258 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PTGDRQ13258 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PTGDRQ13258 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PTGDRQ13258 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PTGDRQ13258 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PTGDRQ13258 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PTGDRQ13258 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PTGDRQ13258 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
PTGDRQ13258 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
PTGDRQ13258 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PTGDRQ13258 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PTGDRQ13258 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PTGDRQ13258 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PTGDRQ13258 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PTGDRQ13258 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PTGDRQ13258 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PTGDRQ13258 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PTGDRQ13258 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PTGDRQ13258 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PTGDRQ13258 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
PTGDRQ13258 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PTGDRQ13258 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PTGDRQ13258 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PTGDRQ13258 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PTGDRQ13258 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PTGDRQ13258 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PTGDRQ13258 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PTGDRQ13258 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PTGDRQ13258 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
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PTGDRQ13258 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PTGDRQ13258 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PTGDRQ13258 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PTGDRQ13258 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PTGDRQ13258 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PTGDRQ13258 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PTGDRQ13258 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
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PTGDRQ13258 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
PTGDRQ13258 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PTGDRQ13258 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PTGDRQ13258 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PTGDRQ13258 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PTGDRQ13258 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PTGDRQ13258 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PTGDRQ13258 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PTGDRQ13258 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PTGDRQ13258 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PTGDRQ13258 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PTGDRQ13258 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PTGDRQ13258 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PTGDRQ13258 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PTGDRQ13258 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PTGDRQ13258 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PTGDRQ13258 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PTGDRQ13258 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PTGDRQ13258 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PTGDRQ13258 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PTGDRQ13258 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PTGDRQ13258 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PTGDRQ13258 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PTGDRQ13258 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PTGDRQ13258 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
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