Protein–RNA interactions for Protein: Q12986

NFX1, Transcriptional repressor NF-X1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,120 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFX1Q12986 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
NFX1Q12986 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
NFX1Q12986 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
NFX1Q12986 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
NFX1Q12986 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
NFX1Q12986 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
NFX1Q12986 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
NFX1Q12986 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
NFX1Q12986 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
NFX1Q12986 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
NFX1Q12986 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
NFX1Q12986 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
NFX1Q12986 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
NFX1Q12986 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
NFX1Q12986 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
NFX1Q12986 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
NFX1Q12986 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
NFX1Q12986 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
NFX1Q12986 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
NFX1Q12986 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
NFX1Q12986 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
NFX1Q12986 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
NFX1Q12986 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
NFX1Q12986 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
NFX1Q12986 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
NFX1Q12986 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
NFX1Q12986 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
NFX1Q12986 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
NFX1Q12986 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
NFX1Q12986 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
NFX1Q12986 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
NFX1Q12986 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
NFX1Q12986 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
NFX1Q12986 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
NFX1Q12986 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
NFX1Q12986 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
NFX1Q12986 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
NFX1Q12986 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
NFX1Q12986 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
NFX1Q12986 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
NFX1Q12986 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
NFX1Q12986 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
NFX1Q12986 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
NFX1Q12986 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
NFX1Q12986 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
NFX1Q12986 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
NFX1Q12986 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
NFX1Q12986 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
NFX1Q12986 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
NFX1Q12986 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
NFX1Q12986 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
NFX1Q12986 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
NFX1Q12986 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
NFX1Q12986 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
NFX1Q12986 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
NFX1Q12986 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
NFX1Q12986 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
NFX1Q12986 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
NFX1Q12986 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
NFX1Q12986 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
NFX1Q12986 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
NFX1Q12986 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
NFX1Q12986 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
NFX1Q12986 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
NFX1Q12986 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
NFX1Q12986 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
NFX1Q12986 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
NFX1Q12986 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
NFX1Q12986 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
NFX1Q12986 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
NFX1Q12986 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
NFX1Q12986 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
NFX1Q12986 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
NFX1Q12986 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
NFX1Q12986 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
NFX1Q12986 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
NFX1Q12986 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
NFX1Q12986 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
NFX1Q12986 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
NFX1Q12986 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
NFX1Q12986 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
NFX1Q12986 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
NFX1Q12986 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
NFX1Q12986 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
NFX1Q12986 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
NFX1Q12986 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
NFX1Q12986 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
NFX1Q12986 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
NFX1Q12986 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
NFX1Q12986 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
NFX1Q12986 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
NFX1Q12986 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
NFX1Q12986 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
NFX1Q12986 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
NFX1Q12986 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
NFX1Q12986 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
NFX1Q12986 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
NFX1Q12986 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
NFX1Q12986 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
NFX1Q12986 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
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