Protein–RNA interactions for Protein: Q12907

LMAN2, Vesicular integral-membrane protein VIP36, humanhuman

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Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMAN2Q12907 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LMAN2Q12907 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LMAN2Q12907 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LMAN2Q12907 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LMAN2Q12907 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LMAN2Q12907 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LMAN2Q12907 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LMAN2Q12907 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LMAN2Q12907 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LMAN2Q12907 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
LMAN2Q12907 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
LMAN2Q12907 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
LMAN2Q12907 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LMAN2Q12907 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LMAN2Q12907 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LMAN2Q12907 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LMAN2Q12907 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
LMAN2Q12907 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LMAN2Q12907 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LMAN2Q12907 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LMAN2Q12907 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LMAN2Q12907 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LMAN2Q12907 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LMAN2Q12907 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LMAN2Q12907 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LMAN2Q12907 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LMAN2Q12907 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
LMAN2Q12907 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LMAN2Q12907 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LMAN2Q12907 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LMAN2Q12907 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LMAN2Q12907 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LMAN2Q12907 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LMAN2Q12907 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LMAN2Q12907 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LMAN2Q12907 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LMAN2Q12907 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LMAN2Q12907 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LMAN2Q12907 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LMAN2Q12907 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LMAN2Q12907 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LMAN2Q12907 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LMAN2Q12907 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LMAN2Q12907 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LMAN2Q12907 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LMAN2Q12907 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LMAN2Q12907 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LMAN2Q12907 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LMAN2Q12907 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LMAN2Q12907 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
LMAN2Q12907 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LMAN2Q12907 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LMAN2Q12907 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LMAN2Q12907 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LMAN2Q12907 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LMAN2Q12907 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LMAN2Q12907 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
LMAN2Q12907 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LMAN2Q12907 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LMAN2Q12907 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LMAN2Q12907 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LMAN2Q12907 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LMAN2Q12907 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LMAN2Q12907 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LMAN2Q12907 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LMAN2Q12907 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LMAN2Q12907 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LMAN2Q12907 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LMAN2Q12907 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LMAN2Q12907 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LMAN2Q12907 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LMAN2Q12907 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LMAN2Q12907 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LMAN2Q12907 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LMAN2Q12907 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
LMAN2Q12907 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LMAN2Q12907 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
LMAN2Q12907 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
LMAN2Q12907 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
LMAN2Q12907 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
LMAN2Q12907 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
LMAN2Q12907 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
LMAN2Q12907 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
LMAN2Q12907 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LMAN2Q12907 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
LMAN2Q12907 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
LMAN2Q12907 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
LMAN2Q12907 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
LMAN2Q12907 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LMAN2Q12907 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LMAN2Q12907 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LMAN2Q12907 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LMAN2Q12907 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LMAN2Q12907 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
LMAN2Q12907 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
LMAN2Q12907 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LMAN2Q12907 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
LMAN2Q12907 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LMAN2Q12907 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LMAN2Q12907 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
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