Protein–RNA interactions for Protein: Q12800

TFCP2, Alpha-globin transcription factor CP2, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFCP2Q12800 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TFCP2Q12800 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TFCP2Q12800 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TFCP2Q12800 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TFCP2Q12800 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TFCP2Q12800 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TFCP2Q12800 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
TFCP2Q12800 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TFCP2Q12800 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TFCP2Q12800 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TFCP2Q12800 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TFCP2Q12800 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TFCP2Q12800 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
TFCP2Q12800 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TFCP2Q12800 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TFCP2Q12800 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TFCP2Q12800 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TFCP2Q12800 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
TFCP2Q12800 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TFCP2Q12800 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TFCP2Q12800 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TFCP2Q12800 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
TFCP2Q12800 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TFCP2Q12800 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TFCP2Q12800 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TFCP2Q12800 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TFCP2Q12800 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TFCP2Q12800 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TFCP2Q12800 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TFCP2Q12800 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TFCP2Q12800 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TFCP2Q12800 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TFCP2Q12800 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
TFCP2Q12800 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TFCP2Q12800 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TFCP2Q12800 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TFCP2Q12800 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TFCP2Q12800 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
TFCP2Q12800 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TFCP2Q12800 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TFCP2Q12800 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TFCP2Q12800 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TFCP2Q12800 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TFCP2Q12800 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TFCP2Q12800 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TFCP2Q12800 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TFCP2Q12800 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TFCP2Q12800 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TFCP2Q12800 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TFCP2Q12800 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TFCP2Q12800 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TFCP2Q12800 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TFCP2Q12800 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TFCP2Q12800 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TFCP2Q12800 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TFCP2Q12800 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TFCP2Q12800 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TFCP2Q12800 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TFCP2Q12800 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TFCP2Q12800 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TFCP2Q12800 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TFCP2Q12800 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TFCP2Q12800 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TFCP2Q12800 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TFCP2Q12800 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TFCP2Q12800 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TFCP2Q12800 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TFCP2Q12800 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TFCP2Q12800 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TFCP2Q12800 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TFCP2Q12800 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TFCP2Q12800 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TFCP2Q12800 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TFCP2Q12800 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TFCP2Q12800 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TFCP2Q12800 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TFCP2Q12800 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TFCP2Q12800 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TFCP2Q12800 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TFCP2Q12800 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TFCP2Q12800 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TFCP2Q12800 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TFCP2Q12800 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TFCP2Q12800 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TFCP2Q12800 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TFCP2Q12800 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TFCP2Q12800 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
TFCP2Q12800 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
TFCP2Q12800 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TFCP2Q12800 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TFCP2Q12800 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TFCP2Q12800 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TFCP2Q12800 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TFCP2Q12800 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TFCP2Q12800 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TFCP2Q12800 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TFCP2Q12800 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TFCP2Q12800 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TFCP2Q12800 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TFCP2Q12800 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.9 ms