Protein–RNA interactions for Protein: Q06547

GABPB1, GA-binding protein subunit beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABPB1Q06547 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GABPB1Q06547 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GABPB1Q06547 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GABPB1Q06547 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GABPB1Q06547 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GABPB1Q06547 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GABPB1Q06547 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
GABPB1Q06547 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GABPB1Q06547 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GABPB1Q06547 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GABPB1Q06547 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GABPB1Q06547 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GABPB1Q06547 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GABPB1Q06547 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GABPB1Q06547 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GABPB1Q06547 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GABPB1Q06547 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GABPB1Q06547 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GABPB1Q06547 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GABPB1Q06547 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GABPB1Q06547 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
GABPB1Q06547 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GABPB1Q06547 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GABPB1Q06547 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GABPB1Q06547 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GABPB1Q06547 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GABPB1Q06547 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GABPB1Q06547 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GABPB1Q06547 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GABPB1Q06547 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GABPB1Q06547 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GABPB1Q06547 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GABPB1Q06547 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GABPB1Q06547 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GABPB1Q06547 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GABPB1Q06547 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GABPB1Q06547 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GABPB1Q06547 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GABPB1Q06547 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GABPB1Q06547 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
GABPB1Q06547 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GABPB1Q06547 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GABPB1Q06547 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GABPB1Q06547 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GABPB1Q06547 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GABPB1Q06547 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GABPB1Q06547 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GABPB1Q06547 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GABPB1Q06547 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GABPB1Q06547 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
GABPB1Q06547 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GABPB1Q06547 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GABPB1Q06547 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GABPB1Q06547 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GABPB1Q06547 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
GABPB1Q06547 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GABPB1Q06547 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GABPB1Q06547 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GABPB1Q06547 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GABPB1Q06547 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
GABPB1Q06547 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
GABPB1Q06547 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GABPB1Q06547 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GABPB1Q06547 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GABPB1Q06547 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GABPB1Q06547 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GABPB1Q06547 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GABPB1Q06547 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GABPB1Q06547 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GABPB1Q06547 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GABPB1Q06547 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GABPB1Q06547 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GABPB1Q06547 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GABPB1Q06547 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GABPB1Q06547 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GABPB1Q06547 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GABPB1Q06547 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GABPB1Q06547 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GABPB1Q06547 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GABPB1Q06547 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GABPB1Q06547 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GABPB1Q06547 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GABPB1Q06547 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GABPB1Q06547 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GABPB1Q06547 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GABPB1Q06547 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GABPB1Q06547 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GABPB1Q06547 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GABPB1Q06547 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
GABPB1Q06547 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
GABPB1Q06547 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
GABPB1Q06547 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GABPB1Q06547 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GABPB1Q06547 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GABPB1Q06547 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GABPB1Q06547 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GABPB1Q06547 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GABPB1Q06547 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GABPB1Q06547 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GABPB1Q06547 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms