Protein–RNA interactions for Protein: Q00987

MDM2, E3 ubiquitin-protein ligase Mdm2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDM2Q00987 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
MDM2Q00987 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
MDM2Q00987 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
MDM2Q00987 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
MDM2Q00987 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
MDM2Q00987 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
MDM2Q00987 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
MDM2Q00987 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
MDM2Q00987 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
MDM2Q00987 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
MDM2Q00987 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
MDM2Q00987 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
MDM2Q00987 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
MDM2Q00987 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
MDM2Q00987 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
MDM2Q00987 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
MDM2Q00987 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
MDM2Q00987 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
MDM2Q00987 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
MDM2Q00987 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
MDM2Q00987 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
MDM2Q00987 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
MDM2Q00987 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
MDM2Q00987 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
MDM2Q00987 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
MDM2Q00987 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
MDM2Q00987 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
MDM2Q00987 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
MDM2Q00987 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
MDM2Q00987 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
MDM2Q00987 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
MDM2Q00987 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
MDM2Q00987 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
MDM2Q00987 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
MDM2Q00987 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
MDM2Q00987 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
MDM2Q00987 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
MDM2Q00987 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
MDM2Q00987 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
MDM2Q00987 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
MDM2Q00987 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
MDM2Q00987 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
MDM2Q00987 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
MDM2Q00987 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
MDM2Q00987 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
MDM2Q00987 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
MDM2Q00987 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
MDM2Q00987 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
MDM2Q00987 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
MDM2Q00987 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
MDM2Q00987 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
MDM2Q00987 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
MDM2Q00987 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
MDM2Q00987 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
MDM2Q00987 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
MDM2Q00987 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
MDM2Q00987 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
MDM2Q00987 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
MDM2Q00987 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
MDM2Q00987 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
MDM2Q00987 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
MDM2Q00987 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
MDM2Q00987 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
MDM2Q00987 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
MDM2Q00987 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
MDM2Q00987 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
MDM2Q00987 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
MDM2Q00987 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
MDM2Q00987 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC20.58■□□□□ 0.89
MDM2Q00987 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
MDM2Q00987 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
MDM2Q00987 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
MDM2Q00987 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
MDM2Q00987 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
MDM2Q00987 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
MDM2Q00987 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
MDM2Q00987 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.88
MDM2Q00987 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
MDM2Q00987 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
MDM2Q00987 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
MDM2Q00987 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.88
MDM2Q00987 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
MDM2Q00987 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
MDM2Q00987 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
MDM2Q00987 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
MDM2Q00987 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
MDM2Q00987 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
MDM2Q00987 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
MDM2Q00987 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
MDM2Q00987 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
MDM2Q00987 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
MDM2Q00987 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
MDM2Q00987 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC20.57■□□□□ 0.88
MDM2Q00987 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
MDM2Q00987 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
MDM2Q00987 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
MDM2Q00987 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
MDM2Q00987 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
MDM2Q00987 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
MDM2Q00987 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms