Protein–RNA interactions for Protein: Q00978

IRF9, Interferon regulatory factor 9, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF9Q00978 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
IRF9Q00978 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
IRF9Q00978 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
IRF9Q00978 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
IRF9Q00978 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
IRF9Q00978 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
IRF9Q00978 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
IRF9Q00978 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
IRF9Q00978 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
IRF9Q00978 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
IRF9Q00978 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
IRF9Q00978 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
IRF9Q00978 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
IRF9Q00978 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
IRF9Q00978 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
IRF9Q00978 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
IRF9Q00978 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
IRF9Q00978 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
IRF9Q00978 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
IRF9Q00978 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
IRF9Q00978 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
IRF9Q00978 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
IRF9Q00978 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
IRF9Q00978 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
IRF9Q00978 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
IRF9Q00978 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
IRF9Q00978 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
IRF9Q00978 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
IRF9Q00978 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
IRF9Q00978 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
IRF9Q00978 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
IRF9Q00978 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
IRF9Q00978 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
IRF9Q00978 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
IRF9Q00978 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
IRF9Q00978 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
IRF9Q00978 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
IRF9Q00978 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
IRF9Q00978 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
IRF9Q00978 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
IRF9Q00978 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
IRF9Q00978 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
IRF9Q00978 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
IRF9Q00978 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
IRF9Q00978 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
IRF9Q00978 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
IRF9Q00978 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
IRF9Q00978 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
IRF9Q00978 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
IRF9Q00978 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
IRF9Q00978 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
IRF9Q00978 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
IRF9Q00978 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
IRF9Q00978 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
IRF9Q00978 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
IRF9Q00978 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
IRF9Q00978 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
IRF9Q00978 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
IRF9Q00978 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
IRF9Q00978 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
IRF9Q00978 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
IRF9Q00978 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
IRF9Q00978 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
IRF9Q00978 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
IRF9Q00978 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
IRF9Q00978 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
IRF9Q00978 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
IRF9Q00978 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
IRF9Q00978 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
IRF9Q00978 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
IRF9Q00978 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
IRF9Q00978 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
IRF9Q00978 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
IRF9Q00978 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
IRF9Q00978 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
IRF9Q00978 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
IRF9Q00978 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
IRF9Q00978 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
IRF9Q00978 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
IRF9Q00978 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
IRF9Q00978 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
IRF9Q00978 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
IRF9Q00978 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
IRF9Q00978 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
IRF9Q00978 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
IRF9Q00978 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
IRF9Q00978 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
IRF9Q00978 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
IRF9Q00978 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
IRF9Q00978 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
IRF9Q00978 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
IRF9Q00978 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
IRF9Q00978 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
IRF9Q00978 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
IRF9Q00978 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
IRF9Q00978 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
IRF9Q00978 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
IRF9Q00978 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
IRF9Q00978 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
IRF9Q00978 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms