Protein–RNA interactions for Protein: P98194

ATP2C1, Calcium-transporting ATPase type 2C member 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2C1P98194 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATP2C1P98194 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATP2C1P98194 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATP2C1P98194 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATP2C1P98194 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATP2C1P98194 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATP2C1P98194 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATP2C1P98194 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATP2C1P98194 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATP2C1P98194 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATP2C1P98194 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATP2C1P98194 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATP2C1P98194 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATP2C1P98194 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATP2C1P98194 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATP2C1P98194 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATP2C1P98194 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATP2C1P98194 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATP2C1P98194 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATP2C1P98194 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATP2C1P98194 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATP2C1P98194 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATP2C1P98194 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
ATP2C1P98194 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATP2C1P98194 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATP2C1P98194 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATP2C1P98194 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATP2C1P98194 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATP2C1P98194 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATP2C1P98194 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATP2C1P98194 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATP2C1P98194 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATP2C1P98194 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATP2C1P98194 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATP2C1P98194 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATP2C1P98194 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATP2C1P98194 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATP2C1P98194 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATP2C1P98194 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATP2C1P98194 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATP2C1P98194 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATP2C1P98194 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATP2C1P98194 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATP2C1P98194 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATP2C1P98194 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATP2C1P98194 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATP2C1P98194 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATP2C1P98194 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATP2C1P98194 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATP2C1P98194 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATP2C1P98194 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATP2C1P98194 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATP2C1P98194 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATP2C1P98194 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATP2C1P98194 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
ATP2C1P98194 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATP2C1P98194 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATP2C1P98194 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATP2C1P98194 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATP2C1P98194 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATP2C1P98194 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATP2C1P98194 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATP2C1P98194 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
ATP2C1P98194 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
ATP2C1P98194 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
ATP2C1P98194 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
ATP2C1P98194 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATP2C1P98194 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATP2C1P98194 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATP2C1P98194 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATP2C1P98194 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATP2C1P98194 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATP2C1P98194 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATP2C1P98194 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATP2C1P98194 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATP2C1P98194 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATP2C1P98194 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATP2C1P98194 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
ATP2C1P98194 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATP2C1P98194 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATP2C1P98194 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATP2C1P98194 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATP2C1P98194 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATP2C1P98194 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATP2C1P98194 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATP2C1P98194 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATP2C1P98194 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATP2C1P98194 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATP2C1P98194 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
ATP2C1P98194 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATP2C1P98194 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATP2C1P98194 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATP2C1P98194 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATP2C1P98194 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATP2C1P98194 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATP2C1P98194 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATP2C1P98194 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATP2C1P98194 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATP2C1P98194 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATP2C1P98194 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms