Protein–RNA interactions for Protein: P82933

MRPS9, 28S ribosomal protein S9, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPS9P82933 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
MRPS9P82933 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MRPS9P82933 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
MRPS9P82933 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MRPS9P82933 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MRPS9P82933 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MRPS9P82933 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
MRPS9P82933 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MRPS9P82933 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MRPS9P82933 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
MRPS9P82933 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MRPS9P82933 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
MRPS9P82933 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MRPS9P82933 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MRPS9P82933 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MRPS9P82933 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MRPS9P82933 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
MRPS9P82933 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MRPS9P82933 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
MRPS9P82933 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
MRPS9P82933 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
MRPS9P82933 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
MRPS9P82933 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
MRPS9P82933 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MRPS9P82933 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MRPS9P82933 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MRPS9P82933 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MRPS9P82933 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
MRPS9P82933 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
MRPS9P82933 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
MRPS9P82933 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MRPS9P82933 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MRPS9P82933 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MRPS9P82933 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
MRPS9P82933 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MRPS9P82933 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MRPS9P82933 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MRPS9P82933 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MRPS9P82933 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
MRPS9P82933 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MRPS9P82933 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MRPS9P82933 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MRPS9P82933 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
MRPS9P82933 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
MRPS9P82933 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
MRPS9P82933 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MRPS9P82933 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MRPS9P82933 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MRPS9P82933 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MRPS9P82933 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MRPS9P82933 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MRPS9P82933 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
MRPS9P82933 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MRPS9P82933 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MRPS9P82933 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
MRPS9P82933 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MRPS9P82933 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
MRPS9P82933 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
MRPS9P82933 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
MRPS9P82933 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MRPS9P82933 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MRPS9P82933 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
MRPS9P82933 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
MRPS9P82933 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
MRPS9P82933 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MRPS9P82933 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MRPS9P82933 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
MRPS9P82933 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MRPS9P82933 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MRPS9P82933 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MRPS9P82933 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
MRPS9P82933 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MRPS9P82933 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MRPS9P82933 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MRPS9P82933 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MRPS9P82933 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
MRPS9P82933 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
MRPS9P82933 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
MRPS9P82933 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
MRPS9P82933 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
MRPS9P82933 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
MRPS9P82933 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
MRPS9P82933 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MRPS9P82933 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MRPS9P82933 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MRPS9P82933 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
MRPS9P82933 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MRPS9P82933 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
MRPS9P82933 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MRPS9P82933 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MRPS9P82933 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MRPS9P82933 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MRPS9P82933 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MRPS9P82933 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
MRPS9P82933 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MRPS9P82933 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
MRPS9P82933 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MRPS9P82933 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
MRPS9P82933 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MRPS9P82933 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms