Protein–RNA interactions for Protein: P78382

SLC35A1, CMP-sialic acid transporter, humanhuman

Predictions only

Length 337 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC35A1P78382 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC35A1P78382 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC35A1P78382 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC35A1P78382 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC35A1P78382 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC35A1P78382 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC35A1P78382 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC35A1P78382 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC35A1P78382 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC35A1P78382 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC35A1P78382 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC35A1P78382 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC35A1P78382 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC35A1P78382 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC35A1P78382 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SLC35A1P78382 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SLC35A1P78382 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SLC35A1P78382 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SLC35A1P78382 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SLC35A1P78382 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SLC35A1P78382 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SLC35A1P78382 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SLC35A1P78382 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC35A1P78382 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC35A1P78382 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC35A1P78382 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC35A1P78382 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC35A1P78382 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC35A1P78382 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC35A1P78382 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC35A1P78382 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC35A1P78382 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC35A1P78382 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC35A1P78382 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC35A1P78382 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC35A1P78382 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC35A1P78382 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC35A1P78382 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC35A1P78382 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC35A1P78382 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC35A1P78382 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC35A1P78382 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC35A1P78382 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC35A1P78382 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC35A1P78382 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC35A1P78382 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC35A1P78382 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC35A1P78382 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC35A1P78382 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC35A1P78382 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC35A1P78382 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC35A1P78382 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC35A1P78382 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC35A1P78382 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC35A1P78382 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC35A1P78382 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC35A1P78382 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC35A1P78382 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC35A1P78382 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC35A1P78382 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC35A1P78382 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC35A1P78382 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC35A1P78382 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC35A1P78382 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC35A1P78382 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC35A1P78382 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC35A1P78382 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC35A1P78382 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC35A1P78382 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC35A1P78382 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC35A1P78382 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC35A1P78382 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC35A1P78382 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC35A1P78382 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC35A1P78382 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC35A1P78382 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC35A1P78382 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC35A1P78382 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC35A1P78382 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC35A1P78382 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC35A1P78382 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC35A1P78382 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC35A1P78382 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC35A1P78382 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC35A1P78382 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC35A1P78382 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC35A1P78382 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC35A1P78382 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC35A1P78382 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC35A1P78382 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC35A1P78382 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC35A1P78382 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC35A1P78382 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC35A1P78382 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC35A1P78382 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC35A1P78382 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC35A1P78382 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC35A1P78382 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC35A1P78382 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC35A1P78382 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms