Protein–RNA interactions for Protein: P68871

HBB, Hemoglobin subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HBBP68871 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
HBBP68871 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
HBBP68871 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
HBBP68871 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
HBBP68871 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
HBBP68871 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
HBBP68871 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
HBBP68871 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
HBBP68871 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
HBBP68871 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
HBBP68871 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
HBBP68871 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
HBBP68871 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
HBBP68871 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
HBBP68871 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
HBBP68871 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
HBBP68871 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
HBBP68871 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
HBBP68871 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC13.34□□□□□ -0.27
HBBP68871 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
HBBP68871 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
HBBP68871 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
HBBP68871 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
HBBP68871 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
HBBP68871 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
HBBP68871 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
HBBP68871 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.34□□□□□ -0.27
HBBP68871 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
HBBP68871 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
HBBP68871 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
HBBP68871 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
HBBP68871 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
HBBP68871 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.27
HBBP68871 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
HBBP68871 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
HBBP68871 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
HBBP68871 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.27
HBBP68871 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
HBBP68871 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
HBBP68871 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
HBBP68871 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
HBBP68871 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
HBBP68871 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
HBBP68871 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
HBBP68871 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
HBBP68871 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
HBBP68871 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
HBBP68871 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
HBBP68871 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
HBBP68871 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
HBBP68871 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.33□□□□□ -0.28
HBBP68871 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
HBBP68871 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
HBBP68871 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
HBBP68871 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
HBBP68871 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
HBBP68871 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
HBBP68871 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
HBBP68871 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
HBBP68871 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
HBBP68871 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
HBBP68871 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
HBBP68871 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
HBBP68871 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
HBBP68871 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
HBBP68871 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
HBBP68871 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
HBBP68871 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
HBBP68871 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
HBBP68871 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
HBBP68871 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
HBBP68871 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
HBBP68871 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
HBBP68871 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
HBBP68871 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
HBBP68871 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
HBBP68871 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
HBBP68871 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
HBBP68871 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
HBBP68871 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
HBBP68871 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
HBBP68871 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
HBBP68871 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
HBBP68871 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
HBBP68871 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
HBBP68871 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
HBBP68871 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
HBBP68871 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
HBBP68871 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
HBBP68871 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
HBBP68871 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
HBBP68871 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
HBBP68871 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
HBBP68871 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
HBBP68871 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
HBBP68871 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
HBBP68871 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
HBBP68871 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
HBBP68871 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
HBBP68871 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms