Protein–RNA interactions for Protein: P62857

RPS28, 40S ribosomal protein S28, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 69 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS28P62857 ELF4-201ENST00000308167 4165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
RPS28P62857 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
RPS28P62857 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
RPS28P62857 PCDH10-203ENST00000618019 4574 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
RPS28P62857 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
RPS28P62857 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
RPS28P62857 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
RPS28P62857 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
RPS28P62857 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
RPS28P62857 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
RPS28P62857 GALNT3-201ENST00000392701 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
RPS28P62857 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
RPS28P62857 MINDY4-201ENST00000265299 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
RPS28P62857 SCYL1-205ENST00000524944 2715 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
RPS28P62857 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
RPS28P62857 SYCP2L-201ENST00000283141 3130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
RPS28P62857 NFIC-206ENST00000589123 8068 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
RPS28P62857 PML-203ENST00000354026 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
RPS28P62857 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
RPS28P62857 PHTF1-204ENST00000369604 3273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
RPS28P62857 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
RPS28P62857 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
RPS28P62857 MYH7-201ENST00000355349 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
RPS28P62857 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
RPS28P62857 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
RPS28P62857 PGAM1P5-202ENST00000552554 2148 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
RPS28P62857 OPRL1-201ENST00000336866 3321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
RPS28P62857 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
RPS28P62857 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC10.3□□□□□ -0.76
RPS28P62857 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
RPS28P62857 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
RPS28P62857 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
RPS28P62857 SETD3-204ENST00000436070 2592 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
RPS28P62857 FAM167A-201ENST00000284486 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
RPS28P62857 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
RPS28P62857 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
RPS28P62857 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
RPS28P62857 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
RPS28P62857 MYD88-203ENST00000417037 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
RPS28P62857 HARS2-201ENST00000230771 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
RPS28P62857 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
RPS28P62857 SGK2-201ENST00000341458 2498 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
RPS28P62857 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
RPS28P62857 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
RPS28P62857 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
RPS28P62857 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
RPS28P62857 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
RPS28P62857 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
RPS28P62857 YWHAEP7-202ENST00000620903 2455 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
RPS28P62857 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
RPS28P62857 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
RPS28P62857 LRP8-201ENST00000306052 7648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
RPS28P62857 C1R-201ENST00000535233 2211 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
RPS28P62857 MARVELD3-201ENST00000268485 2912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
RPS28P62857 SLC38A9-202ENST00000396865 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
RPS28P62857 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
RPS28P62857 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
RPS28P62857 CRYBG1-204ENST00000633556 9909 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
RPS28P62857 CXorf36-201ENST00000377934 2513 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
RPS28P62857 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
RPS28P62857 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
RPS28P62857 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
RPS28P62857 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
RPS28P62857 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
RPS28P62857 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
RPS28P62857 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
RPS28P62857 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
RPS28P62857 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
RPS28P62857 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
RPS28P62857 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
RPS28P62857 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
RPS28P62857 IL3RA-201ENST00000331035 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
RPS28P62857 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
RPS28P62857 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
RPS28P62857 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
RPS28P62857 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
RPS28P62857 MED4-201ENST00000258648 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
RPS28P62857 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
RPS28P62857 RHOH-220ENST00000615083 2156 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.29□□□□□ -0.76
RPS28P62857 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
RPS28P62857 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
RPS28P62857 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
RPS28P62857 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
RPS28P62857 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
RPS28P62857 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
RPS28P62857 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
RPS28P62857 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
RPS28P62857 C12orf43-202ENST00000445832 2397 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
RPS28P62857 PRKN-204ENST00000366896 2514 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
RPS28P62857 ZNF607-201ENST00000355202 4364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
RPS28P62857 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
RPS28P62857 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
RPS28P62857 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
RPS28P62857 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
RPS28P62857 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
RPS28P62857 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
RPS28P62857 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC10.28□□□□□ -0.76
RPS28P62857 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
RPS28P62857 LHFPL2-201ENST00000380345 5043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
RPS28P62857 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
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