Protein–RNA interactions for Protein: P61576

HERV-K104, Endogenous retrovirus group K member 104 Rec protein, humanhuman

Predictions only

Length 105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERV-K104P61576 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HERV-K104P61576 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HERV-K104P61576 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HERV-K104P61576 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HERV-K104P61576 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
HERV-K104P61576 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
HERV-K104P61576 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HERV-K104P61576 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
HERV-K104P61576 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HERV-K104P61576 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HERV-K104P61576 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HERV-K104P61576 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
HERV-K104P61576 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HERV-K104P61576 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HERV-K104P61576 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HERV-K104P61576 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HERV-K104P61576 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HERV-K104P61576 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HERV-K104P61576 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HERV-K104P61576 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
HERV-K104P61576 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HERV-K104P61576 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HERV-K104P61576 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HERV-K104P61576 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
HERV-K104P61576 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
HERV-K104P61576 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HERV-K104P61576 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HERV-K104P61576 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HERV-K104P61576 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
HERV-K104P61576 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
HERV-K104P61576 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
HERV-K104P61576 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
HERV-K104P61576 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HERV-K104P61576 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
HERV-K104P61576 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
HERV-K104P61576 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HERV-K104P61576 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
HERV-K104P61576 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC15.04■□□□□ -0
HERV-K104P61576 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
HERV-K104P61576 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
HERV-K104P61576 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
HERV-K104P61576 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
HERV-K104P61576 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
HERV-K104P61576 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC15.04■□□□□ -0
HERV-K104P61576 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HERV-K104P61576 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
HERV-K104P61576 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
HERV-K104P61576 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HERV-K104P61576 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HERV-K104P61576 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC15.04■□□□□ -0
HERV-K104P61576 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HERV-K104P61576 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HERV-K104P61576 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HERV-K104P61576 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HERV-K104P61576 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HERV-K104P61576 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
HERV-K104P61576 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HERV-K104P61576 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
HERV-K104P61576 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HERV-K104P61576 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HERV-K104P61576 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HERV-K104P61576 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
HERV-K104P61576 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HERV-K104P61576 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HERV-K104P61576 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HERV-K104P61576 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HERV-K104P61576 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HERV-K104P61576 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HERV-K104P61576 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HERV-K104P61576 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
HERV-K104P61576 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HERV-K104P61576 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
HERV-K104P61576 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HERV-K104P61576 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
HERV-K104P61576 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
HERV-K104P61576 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HERV-K104P61576 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HERV-K104P61576 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
HERV-K104P61576 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
HERV-K104P61576 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
HERV-K104P61576 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HERV-K104P61576 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HERV-K104P61576 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HERV-K104P61576 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
HERV-K104P61576 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC15.03■□□□□ -0
HERV-K104P61576 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HERV-K104P61576 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
HERV-K104P61576 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
HERV-K104P61576 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HERV-K104P61576 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC15.03■□□□□ -0
HERV-K104P61576 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HERV-K104P61576 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HERV-K104P61576 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HERV-K104P61576 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
HERV-K104P61576 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HERV-K104P61576 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HERV-K104P61576 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HERV-K104P61576 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HERV-K104P61576 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
HERV-K104P61576 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms