Protein–RNA interactions for Protein: P57059

SIK1, Serine/threonine-protein kinase SIK1, humanhuman

Predictions only

Length 783 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIK1P57059 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SIK1P57059 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SIK1P57059 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SIK1P57059 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SIK1P57059 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
SIK1P57059 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SIK1P57059 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SIK1P57059 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SIK1P57059 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SIK1P57059 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SIK1P57059 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SIK1P57059 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SIK1P57059 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SIK1P57059 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SIK1P57059 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SIK1P57059 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SIK1P57059 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SIK1P57059 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SIK1P57059 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SIK1P57059 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SIK1P57059 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SIK1P57059 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
SIK1P57059 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
SIK1P57059 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SIK1P57059 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SIK1P57059 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SIK1P57059 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SIK1P57059 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SIK1P57059 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SIK1P57059 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SIK1P57059 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SIK1P57059 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SIK1P57059 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SIK1P57059 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SIK1P57059 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SIK1P57059 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SIK1P57059 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SIK1P57059 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SIK1P57059 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SIK1P57059 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SIK1P57059 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
SIK1P57059 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SIK1P57059 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SIK1P57059 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SIK1P57059 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SIK1P57059 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SIK1P57059 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SIK1P57059 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SIK1P57059 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
SIK1P57059 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SIK1P57059 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
SIK1P57059 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SIK1P57059 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SIK1P57059 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SIK1P57059 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SIK1P57059 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SIK1P57059 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SIK1P57059 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SIK1P57059 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SIK1P57059 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SIK1P57059 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SIK1P57059 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SIK1P57059 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SIK1P57059 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SIK1P57059 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SIK1P57059 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SIK1P57059 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SIK1P57059 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SIK1P57059 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SIK1P57059 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SIK1P57059 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
SIK1P57059 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
SIK1P57059 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SIK1P57059 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SIK1P57059 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SIK1P57059 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SIK1P57059 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SIK1P57059 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SIK1P57059 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SIK1P57059 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SIK1P57059 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.2
SIK1P57059 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SIK1P57059 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
SIK1P57059 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SIK1P57059 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
SIK1P57059 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SIK1P57059 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
SIK1P57059 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SIK1P57059 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SIK1P57059 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SIK1P57059 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SIK1P57059 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SIK1P57059 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SIK1P57059 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SIK1P57059 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
SIK1P57059 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SIK1P57059 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SIK1P57059 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
SIK1P57059 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
SIK1P57059 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms