Protein–RNA interactions for Protein: P56159

GFRA1, GDNF family receptor alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GFRA1P56159 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC16■□□□□ 0.15
GFRA1P56159 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GFRA1P56159 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GFRA1P56159 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GFRA1P56159 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GFRA1P56159 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GFRA1P56159 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GFRA1P56159 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GFRA1P56159 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GFRA1P56159 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
GFRA1P56159 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GFRA1P56159 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GFRA1P56159 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GFRA1P56159 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GFRA1P56159 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GFRA1P56159 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GFRA1P56159 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GFRA1P56159 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GFRA1P56159 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GFRA1P56159 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GFRA1P56159 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GFRA1P56159 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GFRA1P56159 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GFRA1P56159 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GFRA1P56159 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GFRA1P56159 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GFRA1P56159 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GFRA1P56159 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GFRA1P56159 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GFRA1P56159 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GFRA1P56159 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
GFRA1P56159 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
GFRA1P56159 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GFRA1P56159 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GFRA1P56159 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GFRA1P56159 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GFRA1P56159 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GFRA1P56159 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GFRA1P56159 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
GFRA1P56159 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GFRA1P56159 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GFRA1P56159 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GFRA1P56159 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GFRA1P56159 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GFRA1P56159 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GFRA1P56159 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GFRA1P56159 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GFRA1P56159 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GFRA1P56159 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GFRA1P56159 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GFRA1P56159 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GFRA1P56159 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GFRA1P56159 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GFRA1P56159 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GFRA1P56159 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GFRA1P56159 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GFRA1P56159 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GFRA1P56159 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GFRA1P56159 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GFRA1P56159 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
GFRA1P56159 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GFRA1P56159 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GFRA1P56159 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GFRA1P56159 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GFRA1P56159 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GFRA1P56159 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GFRA1P56159 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GFRA1P56159 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GFRA1P56159 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GFRA1P56159 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GFRA1P56159 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GFRA1P56159 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GFRA1P56159 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
GFRA1P56159 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GFRA1P56159 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GFRA1P56159 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GFRA1P56159 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GFRA1P56159 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GFRA1P56159 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GFRA1P56159 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GFRA1P56159 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
GFRA1P56159 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GFRA1P56159 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GFRA1P56159 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GFRA1P56159 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GFRA1P56159 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GFRA1P56159 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GFRA1P56159 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GFRA1P56159 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GFRA1P56159 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GFRA1P56159 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GFRA1P56159 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GFRA1P56159 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GFRA1P56159 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GFRA1P56159 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GFRA1P56159 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GFRA1P56159 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GFRA1P56159 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GFRA1P56159 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
GFRA1P56159 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms