Protein–RNA interactions for Protein: P54709

ATP1B3, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1B3P54709 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATP1B3P54709 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATP1B3P54709 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATP1B3P54709 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP1B3P54709 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP1B3P54709 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP1B3P54709 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP1B3P54709 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP1B3P54709 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP1B3P54709 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP1B3P54709 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP1B3P54709 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP1B3P54709 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP1B3P54709 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP1B3P54709 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP1B3P54709 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP1B3P54709 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP1B3P54709 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP1B3P54709 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP1B3P54709 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP1B3P54709 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP1B3P54709 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP1B3P54709 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP1B3P54709 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP1B3P54709 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP1B3P54709 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP1B3P54709 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP1B3P54709 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP1B3P54709 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP1B3P54709 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP1B3P54709 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP1B3P54709 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP1B3P54709 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP1B3P54709 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP1B3P54709 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP1B3P54709 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP1B3P54709 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP1B3P54709 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP1B3P54709 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP1B3P54709 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP1B3P54709 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP1B3P54709 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP1B3P54709 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP1B3P54709 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP1B3P54709 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP1B3P54709 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP1B3P54709 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP1B3P54709 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP1B3P54709 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP1B3P54709 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP1B3P54709 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP1B3P54709 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP1B3P54709 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP1B3P54709 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP1B3P54709 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP1B3P54709 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP1B3P54709 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP1B3P54709 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP1B3P54709 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP1B3P54709 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP1B3P54709 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP1B3P54709 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP1B3P54709 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP1B3P54709 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP1B3P54709 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP1B3P54709 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP1B3P54709 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP1B3P54709 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP1B3P54709 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP1B3P54709 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP1B3P54709 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP1B3P54709 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP1B3P54709 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP1B3P54709 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP1B3P54709 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP1B3P54709 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
ATP1B3P54709 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATP1B3P54709 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATP1B3P54709 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
ATP1B3P54709 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATP1B3P54709 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATP1B3P54709 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATP1B3P54709 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATP1B3P54709 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATP1B3P54709 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATP1B3P54709 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATP1B3P54709 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATP1B3P54709 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATP1B3P54709 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATP1B3P54709 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATP1B3P54709 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATP1B3P54709 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATP1B3P54709 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATP1B3P54709 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATP1B3P54709 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
ATP1B3P54709 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATP1B3P54709 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
ATP1B3P54709 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATP1B3P54709 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATP1B3P54709 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms