Protein–RNA interactions for Protein: P49662

CASP4, Caspase-4, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP4P49662 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CASP4P49662 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CASP4P49662 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CASP4P49662 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CASP4P49662 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CASP4P49662 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CASP4P49662 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CASP4P49662 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CASP4P49662 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CASP4P49662 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CASP4P49662 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CASP4P49662 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
CASP4P49662 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CASP4P49662 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CASP4P49662 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CASP4P49662 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CASP4P49662 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CASP4P49662 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CASP4P49662 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
CASP4P49662 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CASP4P49662 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CASP4P49662 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CASP4P49662 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CASP4P49662 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CASP4P49662 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CASP4P49662 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CASP4P49662 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
CASP4P49662 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CASP4P49662 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CASP4P49662 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CASP4P49662 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CASP4P49662 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CASP4P49662 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CASP4P49662 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CASP4P49662 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CASP4P49662 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CASP4P49662 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CASP4P49662 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CASP4P49662 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CASP4P49662 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CASP4P49662 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CASP4P49662 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CASP4P49662 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CASP4P49662 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CASP4P49662 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CASP4P49662 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CASP4P49662 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CASP4P49662 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CASP4P49662 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CASP4P49662 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CASP4P49662 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CASP4P49662 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CASP4P49662 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
CASP4P49662 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CASP4P49662 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
CASP4P49662 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CASP4P49662 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CASP4P49662 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CASP4P49662 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CASP4P49662 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CASP4P49662 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CASP4P49662 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CASP4P49662 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CASP4P49662 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CASP4P49662 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CASP4P49662 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CASP4P49662 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CASP4P49662 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CASP4P49662 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CASP4P49662 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CASP4P49662 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CASP4P49662 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
CASP4P49662 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
CASP4P49662 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CASP4P49662 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CASP4P49662 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CASP4P49662 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CASP4P49662 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CASP4P49662 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CASP4P49662 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CASP4P49662 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
CASP4P49662 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CASP4P49662 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CASP4P49662 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CASP4P49662 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CASP4P49662 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CASP4P49662 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CASP4P49662 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CASP4P49662 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CASP4P49662 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CASP4P49662 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CASP4P49662 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CASP4P49662 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CASP4P49662 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CASP4P49662 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CASP4P49662 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CASP4P49662 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CASP4P49662 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CASP4P49662 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CASP4P49662 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.8 ms