Protein–RNA interactions for Protein: P45954

ACADSB, Short/branched chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACADSBP45954 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ACADSBP45954 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ACADSBP45954 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ACADSBP45954 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ACADSBP45954 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
ACADSBP45954 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ACADSBP45954 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
ACADSBP45954 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ACADSBP45954 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ACADSBP45954 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ACADSBP45954 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ACADSBP45954 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ACADSBP45954 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ACADSBP45954 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ACADSBP45954 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ACADSBP45954 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ACADSBP45954 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ACADSBP45954 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ACADSBP45954 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ACADSBP45954 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ACADSBP45954 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ACADSBP45954 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ACADSBP45954 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ACADSBP45954 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ACADSBP45954 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ACADSBP45954 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ACADSBP45954 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ACADSBP45954 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ACADSBP45954 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ACADSBP45954 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ACADSBP45954 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ACADSBP45954 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ACADSBP45954 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ACADSBP45954 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ACADSBP45954 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ACADSBP45954 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ACADSBP45954 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
ACADSBP45954 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
ACADSBP45954 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
ACADSBP45954 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
ACADSBP45954 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
ACADSBP45954 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
ACADSBP45954 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
ACADSBP45954 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
ACADSBP45954 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ACADSBP45954 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ACADSBP45954 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ACADSBP45954 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ACADSBP45954 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ACADSBP45954 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ACADSBP45954 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
ACADSBP45954 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ACADSBP45954 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ACADSBP45954 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ACADSBP45954 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ACADSBP45954 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ACADSBP45954 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ACADSBP45954 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ACADSBP45954 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
ACADSBP45954 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ACADSBP45954 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ACADSBP45954 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
ACADSBP45954 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
ACADSBP45954 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ACADSBP45954 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ACADSBP45954 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ACADSBP45954 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ACADSBP45954 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ACADSBP45954 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ACADSBP45954 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ACADSBP45954 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ACADSBP45954 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ACADSBP45954 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ACADSBP45954 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ACADSBP45954 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ACADSBP45954 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
ACADSBP45954 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ACADSBP45954 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ACADSBP45954 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ACADSBP45954 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
ACADSBP45954 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ACADSBP45954 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ACADSBP45954 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ACADSBP45954 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ACADSBP45954 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ACADSBP45954 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ACADSBP45954 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ACADSBP45954 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ACADSBP45954 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ACADSBP45954 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ACADSBP45954 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ACADSBP45954 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ACADSBP45954 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ACADSBP45954 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ACADSBP45954 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ACADSBP45954 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ACADSBP45954 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ACADSBP45954 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ACADSBP45954 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ACADSBP45954 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.9 ms