Protein–RNA interactions for Protein: P41238

APOBEC1, C->U-editing enzyme APOBEC-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC1P41238 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
APOBEC1P41238 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
APOBEC1P41238 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
APOBEC1P41238 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
APOBEC1P41238 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
APOBEC1P41238 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
APOBEC1P41238 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
APOBEC1P41238 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
APOBEC1P41238 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
APOBEC1P41238 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
APOBEC1P41238 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
APOBEC1P41238 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
APOBEC1P41238 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
APOBEC1P41238 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
APOBEC1P41238 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
APOBEC1P41238 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
APOBEC1P41238 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
APOBEC1P41238 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
APOBEC1P41238 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
APOBEC1P41238 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
APOBEC1P41238 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
APOBEC1P41238 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
APOBEC1P41238 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
APOBEC1P41238 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
APOBEC1P41238 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
APOBEC1P41238 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
APOBEC1P41238 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
APOBEC1P41238 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
APOBEC1P41238 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
APOBEC1P41238 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
APOBEC1P41238 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
APOBEC1P41238 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
APOBEC1P41238 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
APOBEC1P41238 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
APOBEC1P41238 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
APOBEC1P41238 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
APOBEC1P41238 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
APOBEC1P41238 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
APOBEC1P41238 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
APOBEC1P41238 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
APOBEC1P41238 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
APOBEC1P41238 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
APOBEC1P41238 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
APOBEC1P41238 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
APOBEC1P41238 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
APOBEC1P41238 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
APOBEC1P41238 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
APOBEC1P41238 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
APOBEC1P41238 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
APOBEC1P41238 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
APOBEC1P41238 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
APOBEC1P41238 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
APOBEC1P41238 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
APOBEC1P41238 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
APOBEC1P41238 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
APOBEC1P41238 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
APOBEC1P41238 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
APOBEC1P41238 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
APOBEC1P41238 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
APOBEC1P41238 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
APOBEC1P41238 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
APOBEC1P41238 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
APOBEC1P41238 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
APOBEC1P41238 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
APOBEC1P41238 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
APOBEC1P41238 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
APOBEC1P41238 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
APOBEC1P41238 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
APOBEC1P41238 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
APOBEC1P41238 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
APOBEC1P41238 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
APOBEC1P41238 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
APOBEC1P41238 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
APOBEC1P41238 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
APOBEC1P41238 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
APOBEC1P41238 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
APOBEC1P41238 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
APOBEC1P41238 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
APOBEC1P41238 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
APOBEC1P41238 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
APOBEC1P41238 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
APOBEC1P41238 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
APOBEC1P41238 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
APOBEC1P41238 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
APOBEC1P41238 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
APOBEC1P41238 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
APOBEC1P41238 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
APOBEC1P41238 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
APOBEC1P41238 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
APOBEC1P41238 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
APOBEC1P41238 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
APOBEC1P41238 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
APOBEC1P41238 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
APOBEC1P41238 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
APOBEC1P41238 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
APOBEC1P41238 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
APOBEC1P41238 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
APOBEC1P41238 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
APOBEC1P41238 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
APOBEC1P41238 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.2 ms