Protein–RNA interactions for Protein: P36406

TRIM23, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM23, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM23P36406 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRIM23P36406 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRIM23P36406 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRIM23P36406 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRIM23P36406 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRIM23P36406 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRIM23P36406 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
TRIM23P36406 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRIM23P36406 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRIM23P36406 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRIM23P36406 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRIM23P36406 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRIM23P36406 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRIM23P36406 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRIM23P36406 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRIM23P36406 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
TRIM23P36406 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
TRIM23P36406 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
TRIM23P36406 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRIM23P36406 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRIM23P36406 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRIM23P36406 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRIM23P36406 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRIM23P36406 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRIM23P36406 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRIM23P36406 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRIM23P36406 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRIM23P36406 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
TRIM23P36406 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRIM23P36406 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRIM23P36406 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRIM23P36406 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRIM23P36406 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRIM23P36406 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRIM23P36406 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRIM23P36406 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRIM23P36406 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRIM23P36406 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRIM23P36406 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRIM23P36406 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRIM23P36406 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRIM23P36406 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRIM23P36406 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRIM23P36406 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRIM23P36406 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRIM23P36406 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
TRIM23P36406 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRIM23P36406 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
TRIM23P36406 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRIM23P36406 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
TRIM23P36406 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
TRIM23P36406 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRIM23P36406 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRIM23P36406 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRIM23P36406 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRIM23P36406 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRIM23P36406 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
TRIM23P36406 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRIM23P36406 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRIM23P36406 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRIM23P36406 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRIM23P36406 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRIM23P36406 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRIM23P36406 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRIM23P36406 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
TRIM23P36406 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRIM23P36406 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRIM23P36406 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRIM23P36406 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TRIM23P36406 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TRIM23P36406 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TRIM23P36406 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TRIM23P36406 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TRIM23P36406 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TRIM23P36406 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TRIM23P36406 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TRIM23P36406 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TRIM23P36406 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TRIM23P36406 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TRIM23P36406 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TRIM23P36406 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TRIM23P36406 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TRIM23P36406 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TRIM23P36406 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TRIM23P36406 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TRIM23P36406 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TRIM23P36406 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
TRIM23P36406 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TRIM23P36406 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TRIM23P36406 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TRIM23P36406 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TRIM23P36406 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TRIM23P36406 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TRIM23P36406 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TRIM23P36406 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TRIM23P36406 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
TRIM23P36406 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TRIM23P36406 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TRIM23P36406 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TRIM23P36406 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms