Protein–RNA interactions for Protein: P35968

KDR, Vascular endothelial growth factor receptor 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDRP35968 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
KDRP35968 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
KDRP35968 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
KDRP35968 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KDRP35968 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
KDRP35968 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KDRP35968 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
KDRP35968 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KDRP35968 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
KDRP35968 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
KDRP35968 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
KDRP35968 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
KDRP35968 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
KDRP35968 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
KDRP35968 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
KDRP35968 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
KDRP35968 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
KDRP35968 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
KDRP35968 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
KDRP35968 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
KDRP35968 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
KDRP35968 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
KDRP35968 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
KDRP35968 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
KDRP35968 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
KDRP35968 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
KDRP35968 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
KDRP35968 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
KDRP35968 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
KDRP35968 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
KDRP35968 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
KDRP35968 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
KDRP35968 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
KDRP35968 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
KDRP35968 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
KDRP35968 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
KDRP35968 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
KDRP35968 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KDRP35968 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
KDRP35968 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
KDRP35968 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
KDRP35968 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
KDRP35968 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
KDRP35968 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
KDRP35968 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
KDRP35968 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
KDRP35968 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
KDRP35968 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
KDRP35968 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
KDRP35968 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
KDRP35968 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
KDRP35968 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
KDRP35968 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KDRP35968 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KDRP35968 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KDRP35968 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KDRP35968 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KDRP35968 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KDRP35968 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
KDRP35968 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KDRP35968 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KDRP35968 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
KDRP35968 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
KDRP35968 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
KDRP35968 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
KDRP35968 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
KDRP35968 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KDRP35968 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
KDRP35968 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
KDRP35968 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
KDRP35968 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KDRP35968 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
KDRP35968 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
KDRP35968 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KDRP35968 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KDRP35968 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KDRP35968 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KDRP35968 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
KDRP35968 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KDRP35968 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
KDRP35968 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
KDRP35968 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KDRP35968 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
KDRP35968 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
KDRP35968 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
KDRP35968 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
KDRP35968 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
KDRP35968 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KDRP35968 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
KDRP35968 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
KDRP35968 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
KDRP35968 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KDRP35968 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KDRP35968 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KDRP35968 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KDRP35968 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
KDRP35968 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KDRP35968 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
KDRP35968 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
KDRP35968 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms