Protein–RNA interactions for Protein: P28290

SSFA2, Sperm-specific antigen 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSFA2P28290 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SSFA2P28290 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
SSFA2P28290 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SSFA2P28290 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SSFA2P28290 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SSFA2P28290 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SSFA2P28290 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SSFA2P28290 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SSFA2P28290 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SSFA2P28290 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SSFA2P28290 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SSFA2P28290 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SSFA2P28290 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SSFA2P28290 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SSFA2P28290 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SSFA2P28290 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SSFA2P28290 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SSFA2P28290 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SSFA2P28290 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SSFA2P28290 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SSFA2P28290 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SSFA2P28290 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SSFA2P28290 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SSFA2P28290 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SSFA2P28290 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SSFA2P28290 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SSFA2P28290 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SSFA2P28290 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SSFA2P28290 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SSFA2P28290 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SSFA2P28290 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SSFA2P28290 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SSFA2P28290 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
SSFA2P28290 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SSFA2P28290 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
SSFA2P28290 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SSFA2P28290 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SSFA2P28290 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SSFA2P28290 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SSFA2P28290 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SSFA2P28290 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SSFA2P28290 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SSFA2P28290 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SSFA2P28290 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SSFA2P28290 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SSFA2P28290 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SSFA2P28290 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SSFA2P28290 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SSFA2P28290 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SSFA2P28290 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SSFA2P28290 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SSFA2P28290 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SSFA2P28290 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SSFA2P28290 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SSFA2P28290 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SSFA2P28290 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SSFA2P28290 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SSFA2P28290 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
SSFA2P28290 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SSFA2P28290 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SSFA2P28290 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
SSFA2P28290 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SSFA2P28290 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SSFA2P28290 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SSFA2P28290 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SSFA2P28290 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SSFA2P28290 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SSFA2P28290 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SSFA2P28290 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SSFA2P28290 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SSFA2P28290 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SSFA2P28290 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SSFA2P28290 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SSFA2P28290 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SSFA2P28290 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SSFA2P28290 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SSFA2P28290 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SSFA2P28290 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SSFA2P28290 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SSFA2P28290 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SSFA2P28290 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SSFA2P28290 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SSFA2P28290 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SSFA2P28290 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SSFA2P28290 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
SSFA2P28290 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
SSFA2P28290 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
SSFA2P28290 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SSFA2P28290 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SSFA2P28290 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SSFA2P28290 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SSFA2P28290 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SSFA2P28290 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SSFA2P28290 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SSFA2P28290 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SSFA2P28290 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SSFA2P28290 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SSFA2P28290 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SSFA2P28290 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SSFA2P28290 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.9 ms