Protein–RNA interactions for Protein: P25105

PTAFR, Platelet-activating factor receptor, humanhuman

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTAFRP25105 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PTAFRP25105 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PTAFRP25105 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PTAFRP25105 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PTAFRP25105 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PTAFRP25105 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PTAFRP25105 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PTAFRP25105 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PTAFRP25105 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PTAFRP25105 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PTAFRP25105 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PTAFRP25105 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PTAFRP25105 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PTAFRP25105 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PTAFRP25105 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PTAFRP25105 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PTAFRP25105 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PTAFRP25105 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PTAFRP25105 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PTAFRP25105 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
PTAFRP25105 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
PTAFRP25105 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PTAFRP25105 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PTAFRP25105 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PTAFRP25105 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PTAFRP25105 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PTAFRP25105 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
PTAFRP25105 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PTAFRP25105 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PTAFRP25105 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
PTAFRP25105 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
PTAFRP25105 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PTAFRP25105 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PTAFRP25105 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PTAFRP25105 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PTAFRP25105 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PTAFRP25105 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PTAFRP25105 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PTAFRP25105 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PTAFRP25105 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PTAFRP25105 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PTAFRP25105 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PTAFRP25105 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PTAFRP25105 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PTAFRP25105 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PTAFRP25105 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PTAFRP25105 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PTAFRP25105 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PTAFRP25105 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PTAFRP25105 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PTAFRP25105 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PTAFRP25105 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PTAFRP25105 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PTAFRP25105 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PTAFRP25105 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PTAFRP25105 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PTAFRP25105 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PTAFRP25105 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PTAFRP25105 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PTAFRP25105 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
PTAFRP25105 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PTAFRP25105 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PTAFRP25105 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
PTAFRP25105 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PTAFRP25105 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PTAFRP25105 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
PTAFRP25105 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
PTAFRP25105 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
PTAFRP25105 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PTAFRP25105 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PTAFRP25105 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PTAFRP25105 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PTAFRP25105 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PTAFRP25105 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PTAFRP25105 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
PTAFRP25105 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PTAFRP25105 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PTAFRP25105 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PTAFRP25105 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PTAFRP25105 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PTAFRP25105 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PTAFRP25105 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PTAFRP25105 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PTAFRP25105 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PTAFRP25105 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PTAFRP25105 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PTAFRP25105 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTAFRP25105 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTAFRP25105 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTAFRP25105 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTAFRP25105 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTAFRP25105 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PTAFRP25105 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTAFRP25105 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTAFRP25105 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTAFRP25105 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTAFRP25105 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTAFRP25105 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTAFRP25105 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTAFRP25105 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.8 ms