Protein–RNA interactions for Protein: P20963

CD247, T-cell surface glycoprotein CD3 zeta chain, humanhuman

Predictions only

Length 164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD247P20963 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CD247P20963 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CD247P20963 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CD247P20963 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CD247P20963 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CD247P20963 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CD247P20963 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CD247P20963 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CD247P20963 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CD247P20963 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CD247P20963 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CD247P20963 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
CD247P20963 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
CD247P20963 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
CD247P20963 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CD247P20963 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CD247P20963 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CD247P20963 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CD247P20963 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CD247P20963 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CD247P20963 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
CD247P20963 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CD247P20963 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CD247P20963 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CD247P20963 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CD247P20963 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CD247P20963 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CD247P20963 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CD247P20963 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CD247P20963 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CD247P20963 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CD247P20963 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CD247P20963 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CD247P20963 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CD247P20963 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CD247P20963 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CD247P20963 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CD247P20963 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CD247P20963 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CD247P20963 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CD247P20963 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CD247P20963 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CD247P20963 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CD247P20963 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CD247P20963 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CD247P20963 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CD247P20963 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CD247P20963 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
CD247P20963 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CD247P20963 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CD247P20963 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CD247P20963 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
CD247P20963 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CD247P20963 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CD247P20963 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CD247P20963 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CD247P20963 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CD247P20963 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CD247P20963 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CD247P20963 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CD247P20963 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CD247P20963 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
CD247P20963 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
CD247P20963 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CD247P20963 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CD247P20963 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CD247P20963 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CD247P20963 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CD247P20963 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CD247P20963 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CD247P20963 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CD247P20963 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CD247P20963 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CD247P20963 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CD247P20963 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CD247P20963 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CD247P20963 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CD247P20963 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CD247P20963 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CD247P20963 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CD247P20963 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CD247P20963 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
CD247P20963 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CD247P20963 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
CD247P20963 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CD247P20963 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CD247P20963 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CD247P20963 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CD247P20963 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CD247P20963 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CD247P20963 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CD247P20963 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CD247P20963 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CD247P20963 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CD247P20963 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CD247P20963 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CD247P20963 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CD247P20963 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CD247P20963 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CD247P20963 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.4 ms