Protein–RNA interactions for Protein: P20339

RAB5A, Ras-related protein Rab-5A, humanhuman

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Length 215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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RAB5AP20339 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
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RAB5AP20339 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
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RAB5AP20339 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
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RAB5AP20339 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
RAB5AP20339 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
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RAB5AP20339 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC13.91□□□□□ -0.18
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RAB5AP20339 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
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RAB5AP20339 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
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RAB5AP20339 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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RAB5AP20339 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
RAB5AP20339 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
RAB5AP20339 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RAB5AP20339 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
RAB5AP20339 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
RAB5AP20339 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
RAB5AP20339 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RAB5AP20339 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RAB5AP20339 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RAB5AP20339 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RAB5AP20339 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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