Protein–RNA interactions for Protein: P17947

SPI1, Transcription factor PU.1, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPI1P17947 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SPI1P17947 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SPI1P17947 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SPI1P17947 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SPI1P17947 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SPI1P17947 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SPI1P17947 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SPI1P17947 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SPI1P17947 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPI1P17947 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPI1P17947 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPI1P17947 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPI1P17947 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPI1P17947 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPI1P17947 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPI1P17947 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPI1P17947 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPI1P17947 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPI1P17947 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPI1P17947 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPI1P17947 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPI1P17947 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPI1P17947 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPI1P17947 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPI1P17947 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPI1P17947 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPI1P17947 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPI1P17947 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPI1P17947 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPI1P17947 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPI1P17947 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPI1P17947 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPI1P17947 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPI1P17947 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPI1P17947 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPI1P17947 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPI1P17947 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPI1P17947 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPI1P17947 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPI1P17947 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPI1P17947 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPI1P17947 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPI1P17947 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SPI1P17947 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPI1P17947 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPI1P17947 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPI1P17947 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SPI1P17947 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPI1P17947 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPI1P17947 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPI1P17947 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPI1P17947 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPI1P17947 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SPI1P17947 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPI1P17947 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPI1P17947 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPI1P17947 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPI1P17947 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPI1P17947 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPI1P17947 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPI1P17947 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPI1P17947 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPI1P17947 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPI1P17947 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPI1P17947 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPI1P17947 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPI1P17947 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPI1P17947 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPI1P17947 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPI1P17947 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPI1P17947 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPI1P17947 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPI1P17947 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPI1P17947 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPI1P17947 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPI1P17947 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPI1P17947 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPI1P17947 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPI1P17947 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPI1P17947 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPI1P17947 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPI1P17947 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPI1P17947 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPI1P17947 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPI1P17947 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPI1P17947 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPI1P17947 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPI1P17947 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPI1P17947 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPI1P17947 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPI1P17947 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPI1P17947 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SPI1P17947 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPI1P17947 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPI1P17947 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPI1P17947 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SPI1P17947 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPI1P17947 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPI1P17947 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPI1P17947 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms