Protein–RNA interactions for Protein: P13224

GP1BB, Platelet glycoprotein Ib beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GP1BBP13224 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GP1BBP13224 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
GP1BBP13224 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GP1BBP13224 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GP1BBP13224 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
GP1BBP13224 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GP1BBP13224 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GP1BBP13224 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GP1BBP13224 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GP1BBP13224 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GP1BBP13224 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GP1BBP13224 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GP1BBP13224 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GP1BBP13224 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GP1BBP13224 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
GP1BBP13224 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GP1BBP13224 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GP1BBP13224 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GP1BBP13224 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GP1BBP13224 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
GP1BBP13224 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GP1BBP13224 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GP1BBP13224 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
GP1BBP13224 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GP1BBP13224 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
GP1BBP13224 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GP1BBP13224 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GP1BBP13224 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GP1BBP13224 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GP1BBP13224 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GP1BBP13224 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GP1BBP13224 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GP1BBP13224 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GP1BBP13224 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GP1BBP13224 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
GP1BBP13224 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GP1BBP13224 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GP1BBP13224 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
GP1BBP13224 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GP1BBP13224 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GP1BBP13224 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GP1BBP13224 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GP1BBP13224 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GP1BBP13224 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GP1BBP13224 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GP1BBP13224 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GP1BBP13224 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GP1BBP13224 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GP1BBP13224 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GP1BBP13224 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GP1BBP13224 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GP1BBP13224 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
GP1BBP13224 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GP1BBP13224 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GP1BBP13224 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GP1BBP13224 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GP1BBP13224 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GP1BBP13224 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GP1BBP13224 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GP1BBP13224 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GP1BBP13224 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GP1BBP13224 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GP1BBP13224 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GP1BBP13224 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GP1BBP13224 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GP1BBP13224 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GP1BBP13224 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GP1BBP13224 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GP1BBP13224 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GP1BBP13224 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GP1BBP13224 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GP1BBP13224 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GP1BBP13224 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GP1BBP13224 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GP1BBP13224 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GP1BBP13224 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GP1BBP13224 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GP1BBP13224 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
GP1BBP13224 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GP1BBP13224 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
GP1BBP13224 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GP1BBP13224 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GP1BBP13224 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GP1BBP13224 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GP1BBP13224 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GP1BBP13224 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GP1BBP13224 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GP1BBP13224 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GP1BBP13224 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GP1BBP13224 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
GP1BBP13224 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
GP1BBP13224 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GP1BBP13224 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GP1BBP13224 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GP1BBP13224 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GP1BBP13224 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GP1BBP13224 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GP1BBP13224 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GP1BBP13224 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
GP1BBP13224 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.4 ms