Protein–RNA interactions for Protein: P12644

BMP4, Bone morphogenetic protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 408 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BMP4P12644 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BMP4P12644 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
BMP4P12644 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
BMP4P12644 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
BMP4P12644 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
BMP4P12644 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
BMP4P12644 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BMP4P12644 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
BMP4P12644 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
BMP4P12644 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BMP4P12644 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
BMP4P12644 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
BMP4P12644 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BMP4P12644 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BMP4P12644 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BMP4P12644 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BMP4P12644 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BMP4P12644 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
BMP4P12644 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BMP4P12644 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BMP4P12644 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BMP4P12644 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BMP4P12644 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BMP4P12644 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BMP4P12644 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BMP4P12644 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BMP4P12644 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BMP4P12644 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
BMP4P12644 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BMP4P12644 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BMP4P12644 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BMP4P12644 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BMP4P12644 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BMP4P12644 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
BMP4P12644 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
BMP4P12644 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
BMP4P12644 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
BMP4P12644 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
BMP4P12644 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
BMP4P12644 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
BMP4P12644 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
BMP4P12644 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
BMP4P12644 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
BMP4P12644 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
BMP4P12644 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BMP4P12644 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
BMP4P12644 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BMP4P12644 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BMP4P12644 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BMP4P12644 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
BMP4P12644 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
BMP4P12644 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BMP4P12644 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BMP4P12644 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BMP4P12644 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BMP4P12644 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
BMP4P12644 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BMP4P12644 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BMP4P12644 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
BMP4P12644 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BMP4P12644 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
BMP4P12644 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BMP4P12644 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BMP4P12644 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BMP4P12644 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
BMP4P12644 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
BMP4P12644 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BMP4P12644 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
BMP4P12644 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BMP4P12644 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
BMP4P12644 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
BMP4P12644 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BMP4P12644 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BMP4P12644 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BMP4P12644 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
BMP4P12644 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BMP4P12644 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
BMP4P12644 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BMP4P12644 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
BMP4P12644 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BMP4P12644 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
BMP4P12644 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
BMP4P12644 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
BMP4P12644 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
BMP4P12644 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BMP4P12644 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BMP4P12644 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
BMP4P12644 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
BMP4P12644 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BMP4P12644 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
BMP4P12644 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BMP4P12644 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
BMP4P12644 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BMP4P12644 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BMP4P12644 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
BMP4P12644 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BMP4P12644 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
BMP4P12644 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BMP4P12644 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BMP4P12644 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms