Protein–RNA interactions for Protein: P10966

CD8B, T-cell surface glycoprotein CD8 beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD8BP10966 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CD8BP10966 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CD8BP10966 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CD8BP10966 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CD8BP10966 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CD8BP10966 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CD8BP10966 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CD8BP10966 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CD8BP10966 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CD8BP10966 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CD8BP10966 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
CD8BP10966 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CD8BP10966 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CD8BP10966 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CD8BP10966 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CD8BP10966 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CD8BP10966 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CD8BP10966 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CD8BP10966 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CD8BP10966 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CD8BP10966 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CD8BP10966 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CD8BP10966 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CD8BP10966 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CD8BP10966 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CD8BP10966 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CD8BP10966 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CD8BP10966 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CD8BP10966 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CD8BP10966 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CD8BP10966 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CD8BP10966 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CD8BP10966 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CD8BP10966 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CD8BP10966 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CD8BP10966 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CD8BP10966 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CD8BP10966 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CD8BP10966 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CD8BP10966 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CD8BP10966 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CD8BP10966 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CD8BP10966 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CD8BP10966 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CD8BP10966 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CD8BP10966 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CD8BP10966 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CD8BP10966 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CD8BP10966 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CD8BP10966 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CD8BP10966 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CD8BP10966 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CD8BP10966 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CD8BP10966 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CD8BP10966 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CD8BP10966 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CD8BP10966 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CD8BP10966 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CD8BP10966 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CD8BP10966 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CD8BP10966 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CD8BP10966 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CD8BP10966 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CD8BP10966 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CD8BP10966 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CD8BP10966 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CD8BP10966 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CD8BP10966 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CD8BP10966 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CD8BP10966 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CD8BP10966 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CD8BP10966 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CD8BP10966 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CD8BP10966 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CD8BP10966 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CD8BP10966 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CD8BP10966 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CD8BP10966 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CD8BP10966 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CD8BP10966 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CD8BP10966 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CD8BP10966 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CD8BP10966 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CD8BP10966 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CD8BP10966 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CD8BP10966 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CD8BP10966 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CD8BP10966 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CD8BP10966 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CD8BP10966 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CD8BP10966 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CD8BP10966 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CD8BP10966 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CD8BP10966 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CD8BP10966 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CD8BP10966 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CD8BP10966 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CD8BP10966 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CD8BP10966 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CD8BP10966 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.4 ms