Protein–RNA interactions for Protein: P0DN76

U2AF1L5, Splicing factor U2AF 35 kDa subunit-like protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2AF1L5P0DN76 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
U2AF1L5P0DN76 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
U2AF1L5P0DN76 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
U2AF1L5P0DN76 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
U2AF1L5P0DN76 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
U2AF1L5P0DN76 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
U2AF1L5P0DN76 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC23.71■■□□□ 1.39
U2AF1L5P0DN76 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
U2AF1L5P0DN76 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
U2AF1L5P0DN76 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
U2AF1L5P0DN76 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
U2AF1L5P0DN76 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
U2AF1L5P0DN76 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
U2AF1L5P0DN76 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
U2AF1L5P0DN76 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC23.7■■□□□ 1.39
U2AF1L5P0DN76 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
U2AF1L5P0DN76 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
U2AF1L5P0DN76 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
U2AF1L5P0DN76 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
U2AF1L5P0DN76 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
U2AF1L5P0DN76 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
U2AF1L5P0DN76 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
U2AF1L5P0DN76 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
U2AF1L5P0DN76 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
U2AF1L5P0DN76 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
U2AF1L5P0DN76 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
U2AF1L5P0DN76 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.38
U2AF1L5P0DN76 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
U2AF1L5P0DN76 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
U2AF1L5P0DN76 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
U2AF1L5P0DN76 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
U2AF1L5P0DN76 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
U2AF1L5P0DN76 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
U2AF1L5P0DN76 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
U2AF1L5P0DN76 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
U2AF1L5P0DN76 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
U2AF1L5P0DN76 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
U2AF1L5P0DN76 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
U2AF1L5P0DN76 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
U2AF1L5P0DN76 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
U2AF1L5P0DN76 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
U2AF1L5P0DN76 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
U2AF1L5P0DN76 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
U2AF1L5P0DN76 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
U2AF1L5P0DN76 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
U2AF1L5P0DN76 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
U2AF1L5P0DN76 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
U2AF1L5P0DN76 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
U2AF1L5P0DN76 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
U2AF1L5P0DN76 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
U2AF1L5P0DN76 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
U2AF1L5P0DN76 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
U2AF1L5P0DN76 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
U2AF1L5P0DN76 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
U2AF1L5P0DN76 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
U2AF1L5P0DN76 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
U2AF1L5P0DN76 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
U2AF1L5P0DN76 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
U2AF1L5P0DN76 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
U2AF1L5P0DN76 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
U2AF1L5P0DN76 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
U2AF1L5P0DN76 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
U2AF1L5P0DN76 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
U2AF1L5P0DN76 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
U2AF1L5P0DN76 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
U2AF1L5P0DN76 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
U2AF1L5P0DN76 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
U2AF1L5P0DN76 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
U2AF1L5P0DN76 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
U2AF1L5P0DN76 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
U2AF1L5P0DN76 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC23.68■■□□□ 1.38
U2AF1L5P0DN76 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
U2AF1L5P0DN76 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
U2AF1L5P0DN76 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
U2AF1L5P0DN76 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
U2AF1L5P0DN76 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
U2AF1L5P0DN76 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
U2AF1L5P0DN76 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
U2AF1L5P0DN76 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
U2AF1L5P0DN76 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
U2AF1L5P0DN76 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
U2AF1L5P0DN76 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
U2AF1L5P0DN76 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
U2AF1L5P0DN76 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
U2AF1L5P0DN76 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
U2AF1L5P0DN76 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
U2AF1L5P0DN76 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
U2AF1L5P0DN76 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
U2AF1L5P0DN76 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
U2AF1L5P0DN76 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
U2AF1L5P0DN76 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
U2AF1L5P0DN76 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
U2AF1L5P0DN76 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
U2AF1L5P0DN76 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
U2AF1L5P0DN76 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
U2AF1L5P0DN76 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
U2AF1L5P0DN76 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC23.67■■□□□ 1.38
U2AF1L5P0DN76 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
U2AF1L5P0DN76 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC23.67■■□□□ 1.38
U2AF1L5P0DN76 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms