Protein–RNA interactions for Protein: P06756

ITGAV, Integrin alpha-V, humanhuman

Predictions only

Length 1,048 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAVP06756 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ITGAVP06756 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ITGAVP06756 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ITGAVP06756 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ITGAVP06756 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ITGAVP06756 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ITGAVP06756 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ITGAVP06756 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ITGAVP06756 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ITGAVP06756 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ITGAVP06756 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ITGAVP06756 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ITGAVP06756 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ITGAVP06756 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ITGAVP06756 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ITGAVP06756 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ITGAVP06756 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ITGAVP06756 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ITGAVP06756 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ITGAVP06756 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ITGAVP06756 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ITGAVP06756 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ITGAVP06756 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
ITGAVP06756 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ITGAVP06756 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ITGAVP06756 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ITGAVP06756 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ITGAVP06756 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
ITGAVP06756 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ITGAVP06756 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ITGAVP06756 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ITGAVP06756 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ITGAVP06756 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ITGAVP06756 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ITGAVP06756 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ITGAVP06756 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ITGAVP06756 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ITGAVP06756 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ITGAVP06756 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ITGAVP06756 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ITGAVP06756 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ITGAVP06756 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ITGAVP06756 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ITGAVP06756 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ITGAVP06756 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ITGAVP06756 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ITGAVP06756 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ITGAVP06756 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
ITGAVP06756 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ITGAVP06756 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ITGAVP06756 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ITGAVP06756 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ITGAVP06756 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ITGAVP06756 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ITGAVP06756 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ITGAVP06756 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ITGAVP06756 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ITGAVP06756 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ITGAVP06756 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ITGAVP06756 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
ITGAVP06756 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ITGAVP06756 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ITGAVP06756 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ITGAVP06756 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ITGAVP06756 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ITGAVP06756 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ITGAVP06756 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ITGAVP06756 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ITGAVP06756 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ITGAVP06756 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ITGAVP06756 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
ITGAVP06756 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
ITGAVP06756 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ITGAVP06756 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ITGAVP06756 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ITGAVP06756 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ITGAVP06756 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ITGAVP06756 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ITGAVP06756 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ITGAVP06756 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ITGAVP06756 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ITGAVP06756 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ITGAVP06756 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ITGAVP06756 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ITGAVP06756 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ITGAVP06756 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ITGAVP06756 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ITGAVP06756 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ITGAVP06756 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ITGAVP06756 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ITGAVP06756 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
ITGAVP06756 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ITGAVP06756 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ITGAVP06756 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ITGAVP06756 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ITGAVP06756 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ITGAVP06756 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ITGAVP06756 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ITGAVP06756 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ITGAVP06756 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms