Protein–RNA interactions for Protein: P01563

IFNA2, Interferon alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 188 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFNA2P01563 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
IFNA2P01563 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
IFNA2P01563 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
IFNA2P01563 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
IFNA2P01563 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
IFNA2P01563 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
IFNA2P01563 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
IFNA2P01563 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
IFNA2P01563 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
IFNA2P01563 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
IFNA2P01563 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
IFNA2P01563 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
IFNA2P01563 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
IFNA2P01563 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
IFNA2P01563 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
IFNA2P01563 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
IFNA2P01563 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
IFNA2P01563 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
IFNA2P01563 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
IFNA2P01563 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
IFNA2P01563 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
IFNA2P01563 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
IFNA2P01563 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
IFNA2P01563 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
IFNA2P01563 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
IFNA2P01563 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
IFNA2P01563 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
IFNA2P01563 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
IFNA2P01563 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
IFNA2P01563 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
IFNA2P01563 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
IFNA2P01563 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
IFNA2P01563 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
IFNA2P01563 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
IFNA2P01563 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
IFNA2P01563 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
IFNA2P01563 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
IFNA2P01563 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
IFNA2P01563 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
IFNA2P01563 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
IFNA2P01563 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
IFNA2P01563 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
IFNA2P01563 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
IFNA2P01563 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
IFNA2P01563 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
IFNA2P01563 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
IFNA2P01563 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
IFNA2P01563 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
IFNA2P01563 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
IFNA2P01563 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
IFNA2P01563 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
IFNA2P01563 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
IFNA2P01563 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
IFNA2P01563 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
IFNA2P01563 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
IFNA2P01563 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
IFNA2P01563 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
IFNA2P01563 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
IFNA2P01563 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IFNA2P01563 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IFNA2P01563 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IFNA2P01563 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IFNA2P01563 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IFNA2P01563 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IFNA2P01563 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
IFNA2P01563 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IFNA2P01563 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IFNA2P01563 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IFNA2P01563 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IFNA2P01563 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IFNA2P01563 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IFNA2P01563 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IFNA2P01563 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IFNA2P01563 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IFNA2P01563 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IFNA2P01563 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IFNA2P01563 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IFNA2P01563 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IFNA2P01563 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IFNA2P01563 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IFNA2P01563 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
IFNA2P01563 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IFNA2P01563 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IFNA2P01563 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IFNA2P01563 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IFNA2P01563 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IFNA2P01563 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IFNA2P01563 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IFNA2P01563 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IFNA2P01563 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IFNA2P01563 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IFNA2P01563 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IFNA2P01563 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IFNA2P01563 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IFNA2P01563 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IFNA2P01563 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IFNA2P01563 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IFNA2P01563 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
IFNA2P01563 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
IFNA2P01563 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms