Protein–RNA interactions for Protein: P01374

LTA, Lymphotoxin-alpha, humanhuman

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Length 205 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTAP01374 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
LTAP01374 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
LTAP01374 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
LTAP01374 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
LTAP01374 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
LTAP01374 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
LTAP01374 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
LTAP01374 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
LTAP01374 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
LTAP01374 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
LTAP01374 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
LTAP01374 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
LTAP01374 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
LTAP01374 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
LTAP01374 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.48□□□□□ -0.25
LTAP01374 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
LTAP01374 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
LTAP01374 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
LTAP01374 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
LTAP01374 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
LTAP01374 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
LTAP01374 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
LTAP01374 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
LTAP01374 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
LTAP01374 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
LTAP01374 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
LTAP01374 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
LTAP01374 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
LTAP01374 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.48□□□□□ -0.25
LTAP01374 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
LTAP01374 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
LTAP01374 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
LTAP01374 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
LTAP01374 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
LTAP01374 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
LTAP01374 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
LTAP01374 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
LTAP01374 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
LTAP01374 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
LTAP01374 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
LTAP01374 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
LTAP01374 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
LTAP01374 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
LTAP01374 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
LTAP01374 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
LTAP01374 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LTAP01374 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LTAP01374 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
LTAP01374 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
LTAP01374 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LTAP01374 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LTAP01374 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
LTAP01374 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LTAP01374 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
LTAP01374 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
LTAP01374 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LTAP01374 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LTAP01374 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
LTAP01374 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LTAP01374 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LTAP01374 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
LTAP01374 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
LTAP01374 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
LTAP01374 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
LTAP01374 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
LTAP01374 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
LTAP01374 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
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LTAP01374 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LTAP01374 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
LTAP01374 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
LTAP01374 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LTAP01374 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LTAP01374 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LTAP01374 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
LTAP01374 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
LTAP01374 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
LTAP01374 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LTAP01374 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
LTAP01374 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LTAP01374 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
LTAP01374 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LTAP01374 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LTAP01374 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LTAP01374 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
LTAP01374 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
LTAP01374 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
LTAP01374 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
LTAP01374 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
LTAP01374 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
LTAP01374 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
LTAP01374 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
LTAP01374 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
LTAP01374 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
LTAP01374 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
LTAP01374 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
LTAP01374 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
LTAP01374 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
LTAP01374 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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