Protein–RNA interactions for Protein: O95602

POLR1A, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,720 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1AO95602 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
POLR1AO95602 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
POLR1AO95602 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
POLR1AO95602 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
POLR1AO95602 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
POLR1AO95602 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
POLR1AO95602 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
POLR1AO95602 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
POLR1AO95602 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
POLR1AO95602 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
POLR1AO95602 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
POLR1AO95602 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
POLR1AO95602 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
POLR1AO95602 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
POLR1AO95602 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
POLR1AO95602 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
POLR1AO95602 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
POLR1AO95602 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
POLR1AO95602 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
POLR1AO95602 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
POLR1AO95602 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
POLR1AO95602 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
POLR1AO95602 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
POLR1AO95602 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
POLR1AO95602 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
POLR1AO95602 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
POLR1AO95602 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC25.8■■□□□ 1.72
POLR1AO95602 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
POLR1AO95602 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
POLR1AO95602 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
POLR1AO95602 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
POLR1AO95602 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
POLR1AO95602 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
POLR1AO95602 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
POLR1AO95602 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
POLR1AO95602 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
POLR1AO95602 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
POLR1AO95602 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
POLR1AO95602 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
POLR1AO95602 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
POLR1AO95602 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
POLR1AO95602 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
POLR1AO95602 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
POLR1AO95602 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
POLR1AO95602 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
POLR1AO95602 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
POLR1AO95602 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
POLR1AO95602 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
POLR1AO95602 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
POLR1AO95602 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
POLR1AO95602 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
POLR1AO95602 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
POLR1AO95602 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
POLR1AO95602 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
POLR1AO95602 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
POLR1AO95602 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
POLR1AO95602 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
POLR1AO95602 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
POLR1AO95602 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
POLR1AO95602 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
POLR1AO95602 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
POLR1AO95602 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
POLR1AO95602 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
POLR1AO95602 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
POLR1AO95602 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
POLR1AO95602 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC25.77■■□□□ 1.72
POLR1AO95602 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
POLR1AO95602 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
POLR1AO95602 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
POLR1AO95602 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
POLR1AO95602 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
POLR1AO95602 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
POLR1AO95602 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
POLR1AO95602 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
POLR1AO95602 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
POLR1AO95602 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
POLR1AO95602 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
POLR1AO95602 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
POLR1AO95602 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
POLR1AO95602 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC25.77■■□□□ 1.72
POLR1AO95602 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
POLR1AO95602 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
POLR1AO95602 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
POLR1AO95602 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
POLR1AO95602 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
POLR1AO95602 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
POLR1AO95602 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
POLR1AO95602 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
POLR1AO95602 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
POLR1AO95602 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
POLR1AO95602 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
POLR1AO95602 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
POLR1AO95602 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
POLR1AO95602 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
POLR1AO95602 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
POLR1AO95602 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
POLR1AO95602 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
POLR1AO95602 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
POLR1AO95602 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
POLR1AO95602 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.6 ms