Protein–RNA interactions for Protein: O95487

SEC24B, Protein transport protein Sec24B, humanhuman

Predictions only

Length 1,268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC24BO95487 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SEC24BO95487 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SEC24BO95487 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SEC24BO95487 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SEC24BO95487 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SEC24BO95487 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SEC24BO95487 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SEC24BO95487 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SEC24BO95487 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SEC24BO95487 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SEC24BO95487 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SEC24BO95487 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SEC24BO95487 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SEC24BO95487 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SEC24BO95487 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SEC24BO95487 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
SEC24BO95487 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SEC24BO95487 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SEC24BO95487 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SEC24BO95487 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SEC24BO95487 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SEC24BO95487 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SEC24BO95487 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SEC24BO95487 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SEC24BO95487 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SEC24BO95487 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SEC24BO95487 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SEC24BO95487 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SEC24BO95487 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SEC24BO95487 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SEC24BO95487 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SEC24BO95487 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SEC24BO95487 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SEC24BO95487 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SEC24BO95487 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SEC24BO95487 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SEC24BO95487 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SEC24BO95487 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
SEC24BO95487 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SEC24BO95487 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SEC24BO95487 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
SEC24BO95487 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SEC24BO95487 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SEC24BO95487 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SEC24BO95487 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SEC24BO95487 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SEC24BO95487 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
SEC24BO95487 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SEC24BO95487 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
SEC24BO95487 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SEC24BO95487 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
SEC24BO95487 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SEC24BO95487 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SEC24BO95487 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SEC24BO95487 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SEC24BO95487 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SEC24BO95487 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SEC24BO95487 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SEC24BO95487 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SEC24BO95487 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SEC24BO95487 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SEC24BO95487 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SEC24BO95487 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SEC24BO95487 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SEC24BO95487 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SEC24BO95487 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SEC24BO95487 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SEC24BO95487 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SEC24BO95487 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SEC24BO95487 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SEC24BO95487 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SEC24BO95487 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SEC24BO95487 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SEC24BO95487 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SEC24BO95487 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SEC24BO95487 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SEC24BO95487 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SEC24BO95487 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SEC24BO95487 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SEC24BO95487 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SEC24BO95487 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SEC24BO95487 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SEC24BO95487 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SEC24BO95487 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SEC24BO95487 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SEC24BO95487 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
SEC24BO95487 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SEC24BO95487 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SEC24BO95487 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SEC24BO95487 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
SEC24BO95487 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SEC24BO95487 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SEC24BO95487 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SEC24BO95487 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SEC24BO95487 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SEC24BO95487 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SEC24BO95487 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SEC24BO95487 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SEC24BO95487 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SEC24BO95487 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms