Protein–RNA interactions for Protein: O75508

CLDN11, Claudin-11, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN11O75508 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CLDN11O75508 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CLDN11O75508 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CLDN11O75508 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CLDN11O75508 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CLDN11O75508 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CLDN11O75508 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CLDN11O75508 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLDN11O75508 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CLDN11O75508 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLDN11O75508 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLDN11O75508 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLDN11O75508 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLDN11O75508 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLDN11O75508 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLDN11O75508 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLDN11O75508 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLDN11O75508 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLDN11O75508 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLDN11O75508 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLDN11O75508 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CLDN11O75508 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLDN11O75508 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLDN11O75508 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLDN11O75508 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CLDN11O75508 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLDN11O75508 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLDN11O75508 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLDN11O75508 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLDN11O75508 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLDN11O75508 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLDN11O75508 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLDN11O75508 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLDN11O75508 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLDN11O75508 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLDN11O75508 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLDN11O75508 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLDN11O75508 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLDN11O75508 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLDN11O75508 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLDN11O75508 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLDN11O75508 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLDN11O75508 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLDN11O75508 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLDN11O75508 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLDN11O75508 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLDN11O75508 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLDN11O75508 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CLDN11O75508 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLDN11O75508 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLDN11O75508 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLDN11O75508 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLDN11O75508 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLDN11O75508 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLDN11O75508 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLDN11O75508 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLDN11O75508 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLDN11O75508 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLDN11O75508 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLDN11O75508 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLDN11O75508 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLDN11O75508 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLDN11O75508 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLDN11O75508 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLDN11O75508 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLDN11O75508 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLDN11O75508 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLDN11O75508 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLDN11O75508 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLDN11O75508 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLDN11O75508 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLDN11O75508 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLDN11O75508 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLDN11O75508 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLDN11O75508 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLDN11O75508 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLDN11O75508 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLDN11O75508 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLDN11O75508 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLDN11O75508 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLDN11O75508 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLDN11O75508 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLDN11O75508 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLDN11O75508 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CLDN11O75508 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CLDN11O75508 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CLDN11O75508 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CLDN11O75508 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CLDN11O75508 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CLDN11O75508 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CLDN11O75508 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CLDN11O75508 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CLDN11O75508 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CLDN11O75508 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CLDN11O75508 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CLDN11O75508 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CLDN11O75508 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CLDN11O75508 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CLDN11O75508 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CLDN11O75508 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms