Protein–RNA interactions for Protein: O75145

PPFIA3, Liprin-alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,194 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIA3O75145 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PPFIA3O75145 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PPFIA3O75145 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PPFIA3O75145 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PPFIA3O75145 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PPFIA3O75145 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PPFIA3O75145 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PPFIA3O75145 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PPFIA3O75145 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PPFIA3O75145 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PPFIA3O75145 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PPFIA3O75145 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
PPFIA3O75145 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PPFIA3O75145 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PPFIA3O75145 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PPFIA3O75145 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PPFIA3O75145 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PPFIA3O75145 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PPFIA3O75145 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PPFIA3O75145 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PPFIA3O75145 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PPFIA3O75145 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
PPFIA3O75145 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PPFIA3O75145 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PPFIA3O75145 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PPFIA3O75145 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PPFIA3O75145 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PPFIA3O75145 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PPFIA3O75145 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PPFIA3O75145 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PPFIA3O75145 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PPFIA3O75145 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PPFIA3O75145 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
PPFIA3O75145 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PPFIA3O75145 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PPFIA3O75145 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PPFIA3O75145 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PPFIA3O75145 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PPFIA3O75145 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PPFIA3O75145 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PPFIA3O75145 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
PPFIA3O75145 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PPFIA3O75145 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PPFIA3O75145 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PPFIA3O75145 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PPFIA3O75145 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PPFIA3O75145 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PPFIA3O75145 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PPFIA3O75145 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PPFIA3O75145 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
PPFIA3O75145 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PPFIA3O75145 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PPFIA3O75145 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PPFIA3O75145 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PPFIA3O75145 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PPFIA3O75145 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PPFIA3O75145 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PPFIA3O75145 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PPFIA3O75145 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PPFIA3O75145 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PPFIA3O75145 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PPFIA3O75145 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PPFIA3O75145 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PPFIA3O75145 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PPFIA3O75145 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PPFIA3O75145 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PPFIA3O75145 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PPFIA3O75145 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PPFIA3O75145 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PPFIA3O75145 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PPFIA3O75145 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PPFIA3O75145 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PPFIA3O75145 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
PPFIA3O75145 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PPFIA3O75145 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PPFIA3O75145 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PPFIA3O75145 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PPFIA3O75145 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PPFIA3O75145 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PPFIA3O75145 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PPFIA3O75145 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PPFIA3O75145 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PPFIA3O75145 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PPFIA3O75145 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PPFIA3O75145 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PPFIA3O75145 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PPFIA3O75145 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PPFIA3O75145 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PPFIA3O75145 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PPFIA3O75145 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PPFIA3O75145 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PPFIA3O75145 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PPFIA3O75145 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PPFIA3O75145 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PPFIA3O75145 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PPFIA3O75145 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PPFIA3O75145 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PPFIA3O75145 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PPFIA3O75145 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
PPFIA3O75145 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.4 ms