Protein–RNA interactions for Protein: O60759

CYTIP, Cytohesin-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYTIPO60759 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CYTIPO60759 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CYTIPO60759 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CYTIPO60759 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CYTIPO60759 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CYTIPO60759 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CYTIPO60759 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CYTIPO60759 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CYTIPO60759 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CYTIPO60759 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CYTIPO60759 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CYTIPO60759 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CYTIPO60759 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CYTIPO60759 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CYTIPO60759 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CYTIPO60759 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CYTIPO60759 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
CYTIPO60759 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.14
CYTIPO60759 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
CYTIPO60759 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CYTIPO60759 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.14
CYTIPO60759 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CYTIPO60759 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CYTIPO60759 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CYTIPO60759 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CYTIPO60759 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CYTIPO60759 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CYTIPO60759 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CYTIPO60759 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CYTIPO60759 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CYTIPO60759 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CYTIPO60759 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CYTIPO60759 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CYTIPO60759 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CYTIPO60759 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CYTIPO60759 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CYTIPO60759 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CYTIPO60759 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CYTIPO60759 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CYTIPO60759 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CYTIPO60759 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CYTIPO60759 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CYTIPO60759 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CYTIPO60759 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CYTIPO60759 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CYTIPO60759 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CYTIPO60759 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CYTIPO60759 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CYTIPO60759 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CYTIPO60759 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CYTIPO60759 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CYTIPO60759 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CYTIPO60759 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CYTIPO60759 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CYTIPO60759 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CYTIPO60759 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CYTIPO60759 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CYTIPO60759 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CYTIPO60759 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CYTIPO60759 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CYTIPO60759 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CYTIPO60759 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CYTIPO60759 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CYTIPO60759 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CYTIPO60759 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CYTIPO60759 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CYTIPO60759 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CYTIPO60759 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CYTIPO60759 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CYTIPO60759 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CYTIPO60759 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CYTIPO60759 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CYTIPO60759 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CYTIPO60759 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CYTIPO60759 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CYTIPO60759 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CYTIPO60759 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CYTIPO60759 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CYTIPO60759 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CYTIPO60759 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CYTIPO60759 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CYTIPO60759 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CYTIPO60759 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CYTIPO60759 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CYTIPO60759 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CYTIPO60759 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CYTIPO60759 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CYTIPO60759 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CYTIPO60759 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CYTIPO60759 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CYTIPO60759 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CYTIPO60759 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CYTIPO60759 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CYTIPO60759 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CYTIPO60759 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CYTIPO60759 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CYTIPO60759 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CYTIPO60759 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CYTIPO60759 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CYTIPO60759 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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