Protein–RNA interactions for Protein: O60238

BNIP3L, BCL2/adenovirus E1B 19 kDa protein-interacting protein 3-like, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNIP3LO60238 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
BNIP3LO60238 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
BNIP3LO60238 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
BNIP3LO60238 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
BNIP3LO60238 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
BNIP3LO60238 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
BNIP3LO60238 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
BNIP3LO60238 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
BNIP3LO60238 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
BNIP3LO60238 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
BNIP3LO60238 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
BNIP3LO60238 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
BNIP3LO60238 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
BNIP3LO60238 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
BNIP3LO60238 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
BNIP3LO60238 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
BNIP3LO60238 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
BNIP3LO60238 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
BNIP3LO60238 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
BNIP3LO60238 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
BNIP3LO60238 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
BNIP3LO60238 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
BNIP3LO60238 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
BNIP3LO60238 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
BNIP3LO60238 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
BNIP3LO60238 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
BNIP3LO60238 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
BNIP3LO60238 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
BNIP3LO60238 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
BNIP3LO60238 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
BNIP3LO60238 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
BNIP3LO60238 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
BNIP3LO60238 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
BNIP3LO60238 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
BNIP3LO60238 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
BNIP3LO60238 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
BNIP3LO60238 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
BNIP3LO60238 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
BNIP3LO60238 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
BNIP3LO60238 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
BNIP3LO60238 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
BNIP3LO60238 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
BNIP3LO60238 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
BNIP3LO60238 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
BNIP3LO60238 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
BNIP3LO60238 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
BNIP3LO60238 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
BNIP3LO60238 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
BNIP3LO60238 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
BNIP3LO60238 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
BNIP3LO60238 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
BNIP3LO60238 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
BNIP3LO60238 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
BNIP3LO60238 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
BNIP3LO60238 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
BNIP3LO60238 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
BNIP3LO60238 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
BNIP3LO60238 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
BNIP3LO60238 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
BNIP3LO60238 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
BNIP3LO60238 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
BNIP3LO60238 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
BNIP3LO60238 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
BNIP3LO60238 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
BNIP3LO60238 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
BNIP3LO60238 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
BNIP3LO60238 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
BNIP3LO60238 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
BNIP3LO60238 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
BNIP3LO60238 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
BNIP3LO60238 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
BNIP3LO60238 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
BNIP3LO60238 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
BNIP3LO60238 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
BNIP3LO60238 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
BNIP3LO60238 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
BNIP3LO60238 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
BNIP3LO60238 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
BNIP3LO60238 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
BNIP3LO60238 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
BNIP3LO60238 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
BNIP3LO60238 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
BNIP3LO60238 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
BNIP3LO60238 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
BNIP3LO60238 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
BNIP3LO60238 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
BNIP3LO60238 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
BNIP3LO60238 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
BNIP3LO60238 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
BNIP3LO60238 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
BNIP3LO60238 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
BNIP3LO60238 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
BNIP3LO60238 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
BNIP3LO60238 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
BNIP3LO60238 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
BNIP3LO60238 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
BNIP3LO60238 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BNIP3LO60238 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BNIP3LO60238 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BNIP3LO60238 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.5 ms