Protein–RNA interactions for Protein: O43525

KCNQ3, Potassium voltage-gated channel subfamily KQT member 3, humanhuman

Predictions only

Length 872 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNQ3O43525 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KCNQ3O43525 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KCNQ3O43525 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KCNQ3O43525 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KCNQ3O43525 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
KCNQ3O43525 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
KCNQ3O43525 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KCNQ3O43525 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KCNQ3O43525 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KCNQ3O43525 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KCNQ3O43525 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KCNQ3O43525 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KCNQ3O43525 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KCNQ3O43525 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KCNQ3O43525 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KCNQ3O43525 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
KCNQ3O43525 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
KCNQ3O43525 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
KCNQ3O43525 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
KCNQ3O43525 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
KCNQ3O43525 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
KCNQ3O43525 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
KCNQ3O43525 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
KCNQ3O43525 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
KCNQ3O43525 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
KCNQ3O43525 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
KCNQ3O43525 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
KCNQ3O43525 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
KCNQ3O43525 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
KCNQ3O43525 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
KCNQ3O43525 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
KCNQ3O43525 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
KCNQ3O43525 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
KCNQ3O43525 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
KCNQ3O43525 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
KCNQ3O43525 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
KCNQ3O43525 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KCNQ3O43525 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KCNQ3O43525 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KCNQ3O43525 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KCNQ3O43525 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KCNQ3O43525 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
KCNQ3O43525 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KCNQ3O43525 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KCNQ3O43525 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KCNQ3O43525 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KCNQ3O43525 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KCNQ3O43525 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KCNQ3O43525 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KCNQ3O43525 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
KCNQ3O43525 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
KCNQ3O43525 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KCNQ3O43525 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KCNQ3O43525 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KCNQ3O43525 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
KCNQ3O43525 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KCNQ3O43525 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KCNQ3O43525 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KCNQ3O43525 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
KCNQ3O43525 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KCNQ3O43525 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KCNQ3O43525 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KCNQ3O43525 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KCNQ3O43525 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KCNQ3O43525 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KCNQ3O43525 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KCNQ3O43525 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KCNQ3O43525 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KCNQ3O43525 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KCNQ3O43525 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KCNQ3O43525 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KCNQ3O43525 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KCNQ3O43525 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KCNQ3O43525 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KCNQ3O43525 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KCNQ3O43525 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KCNQ3O43525 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
KCNQ3O43525 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KCNQ3O43525 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KCNQ3O43525 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KCNQ3O43525 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
KCNQ3O43525 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KCNQ3O43525 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KCNQ3O43525 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KCNQ3O43525 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KCNQ3O43525 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KCNQ3O43525 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KCNQ3O43525 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KCNQ3O43525 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KCNQ3O43525 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KCNQ3O43525 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KCNQ3O43525 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KCNQ3O43525 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KCNQ3O43525 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KCNQ3O43525 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KCNQ3O43525 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KCNQ3O43525 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KCNQ3O43525 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KCNQ3O43525 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KCNQ3O43525 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms