Protein–RNA interactions for Protein: O43520

ATP8B1, Phospholipid-transporting ATPase IC, humanhuman

Predictions only

Length 1,251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP8B1O43520 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATP8B1O43520 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
ATP8B1O43520 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATP8B1O43520 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATP8B1O43520 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATP8B1O43520 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATP8B1O43520 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATP8B1O43520 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP8B1O43520 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP8B1O43520 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP8B1O43520 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP8B1O43520 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP8B1O43520 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP8B1O43520 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP8B1O43520 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP8B1O43520 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP8B1O43520 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP8B1O43520 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP8B1O43520 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP8B1O43520 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP8B1O43520 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP8B1O43520 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP8B1O43520 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP8B1O43520 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP8B1O43520 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP8B1O43520 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP8B1O43520 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP8B1O43520 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP8B1O43520 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP8B1O43520 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP8B1O43520 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP8B1O43520 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP8B1O43520 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP8B1O43520 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP8B1O43520 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP8B1O43520 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP8B1O43520 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP8B1O43520 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP8B1O43520 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP8B1O43520 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP8B1O43520 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP8B1O43520 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP8B1O43520 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP8B1O43520 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP8B1O43520 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP8B1O43520 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP8B1O43520 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP8B1O43520 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP8B1O43520 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP8B1O43520 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP8B1O43520 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP8B1O43520 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP8B1O43520 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP8B1O43520 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP8B1O43520 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP8B1O43520 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP8B1O43520 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP8B1O43520 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP8B1O43520 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP8B1O43520 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP8B1O43520 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP8B1O43520 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP8B1O43520 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP8B1O43520 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP8B1O43520 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP8B1O43520 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP8B1O43520 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP8B1O43520 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP8B1O43520 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP8B1O43520 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP8B1O43520 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP8B1O43520 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP8B1O43520 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP8B1O43520 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP8B1O43520 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP8B1O43520 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP8B1O43520 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP8B1O43520 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP8B1O43520 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP8B1O43520 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP8B1O43520 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP8B1O43520 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP8B1O43520 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP8B1O43520 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP8B1O43520 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP8B1O43520 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP8B1O43520 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP8B1O43520 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP8B1O43520 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP8B1O43520 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP8B1O43520 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP8B1O43520 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP8B1O43520 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP8B1O43520 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP8B1O43520 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP8B1O43520 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP8B1O43520 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP8B1O43520 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP8B1O43520 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP8B1O43520 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms